การแข่งขันกีฬาว่ายน้ำในโอลิมปิกฤดูร้อน 2016 รอบคัดเลือก เป็นการแข่งขันว่ายน้ำเพื่อคัดเลือกนักกีฬาเข้าแข่งขันกีฬาโอลิมปิกฤดูร้อน 2016 ณ เมืองริโอเดอจาเนโร ประเทศบราซิล โดยมีโค้วต้าทั้งหมด 136 คน แต่ละประเทศสามารถส่งนักกีฬาเข้าแข่งขันได้สูงสุด 2 คน (2 คนต่อรายการ) การคัดเลือกสิ้นสุดเมื่อวันที่ 3 กรกฎาคม ค.ศ. 2016