ชาวแพลเนตบอมเบอร์อาศัยอยู่อย่างสงบสุข โดยได้รับการคุ้มครองจากวิญญาณทั้งห้า จนกระทั่งบิวเกลียร์ผู้ชั่วร้ายและกองทัพหุ่นยนต์ของเขาบุกเข้ามา ภาพวิญญาณซึ่งเป็นแหล่งที่มาของพลังเวทมนตร์ของวิญญาณ ได้ถูกทำลายและแยกแพลเนตบอมเบอร์ออกเป็นห้าส่วน ซึ่งบอมเบอร์แมนได้มาถึงเพื่อฟื้นฟูสภาพของภาพวิญญาณ และทำให้แพลเนตบอมเบอร์รวมกันอีกครั้ง