โปเกมอน ไดมอนด์ แอนด์ เพิร์ล เป็นซีรีส์ที่นำมาจากเกม โปเกมอน ไดมอนด์และเพิร์ล โดยใช้ชื่อเวอร์ชันเกมจากเจนเนเรชันที่ 4 และอิงเขตประเทศที่ปรากฏในเกม โดยเขตในภาคนี้มีชื่อว่า ชินโอ ในซีรีส์นี้ ฮารุกะ และ มาซาโตะ ไม่ได้ร่วมเดินทางกับซาโตชิแล้ว หลังจากที่ร่วมทีมกับซาโตชิต่อเนื่องเป็นเวลานานในซีรีส์ที่ผ่านมา และมีตัวละครหลักตัวใหม่คือ ฮิคาริ ผู้ฝึกโปเกมอนมือใหม่ที่มุ่งหวังอยากจะเป็น โปเกมอน โคออดิเนเตอร์ เธอมาจากเมืองฟุตาบะ และตัวละครอีกคนคือ ทาเคชิ เพื่อนของซาโตชิที่คอยให้คำแนะนำอย่างใกล้ชิดมาตั้งแต่ตอนแรก ๆ ของเรื่อง ได้กลับมาร่วมทีมอีกครั้งในช่วงเริ่มต้นซีรีส์ ส่วนฮารุกะเองนั้นได้ปรากฏตัวในซีรีส์นี้แค่ 1 ครั้ง เท่านั้นโดยฮารุกะปรากฏด้วยเสื้อผ้าชุดใหม่

อีกหนึ่งสิ่งที่เปลี่ยนไปคือชุดเสื้อผ้าใหม่ของซาโตชิและทาเคชิ โดยซาโตชิจะไม่ได้สวมเสื้อตัวเก่าที่ถูกพวกแก๊งร็อคเก็ตเล่นงานจนขาดเป็นเสี่ยงๆ แต่แล้วกลับเปลี่ยนเป็นชุดใหม่ทั้งตัวคล้ายกับภาค Advanced Generation แต่ชุดนี้จะเป็นสีน้ำเงิน

ซีรีส์ไดมอนด์ แอนด์ เพิร์ล ยังมีความเปลี่ยนแปลงอีกอย่างหนึ่งจากซีรีส์ที่ 2 กล่าวคือ ซีรีส์นี้ยังเป็นซีรีส์ที่ซาโตชิจะพบกับคู่แข่งคนใหม่ที่เจอกันตอนต้นซีรีส์ นั่นก็คือ ชินจิ รวมถึงศัตรูอีกกลุ่มที่มีอิทธิพลประจำเขตชินโอ คือ แก๊งกิงกะ