ปี 2554 เว็บไซต์ www.cm108.com ได้มีการเสนอข่าวเกี่ยวกับนักศึกษามหาวิทยาลัยแม่โจ้ได้ทำการเดินขบวนประท้วงปิดมหาวิทยาลัยเนื่องจากอธิการบดีลดเวลาการรับน้องลง โดยในเว็บบอร์ดของเว็บไซต์ดังกล่าวได้มีผู้อ้างเป็นนักศึกษาและศิษย์เก่าของมหาวิทยาลัยแม่โจ้โพสต์ข้อความเชิงข่มขู่ต่อผู้เสนอข่าวที่เสนอเรื่องของการรับน้องของมหาวิทยาลัยแม่โจ้รวมถึงมีการขู่ฆ่าผู้นำเสนอข่าวและอธิการบดีที่ลดเวลาการรับน้องลงด้วย [10]

ปี 2558 ได้เกิดเหตุระเบิดจากการประกอบประทัดยักษ์สำหรับการรับน้องส่งผลให้นักศึกษาชั้นปีที่ 2 ของได้รับบาดเจ็บสาหัสจนมือซ้ายและขาซ้ายขาด[11] อย่างไรก็ตามรองอธิการบดี ฝ่ายพัฒนานักศึกษาและศิษย์เก่าสัมพันธ์ของมหาวิทยาลัยได้ปฏิเสธในเรื่องของการใช้ระเบิดประกอบการรับน้องดังกล่าว [12]

ปี 2560 เพจเฟซบุ๊ก ANTI SOTUS ได้เผยแพร่ภาพจากเฟซบุ๊กของนักศึกษารุ่นพี่ของมหาวิทยาลัยซึ่งได้ตำนินักศึกษารุ่นน้องที่สวมรองเท้าแตะพร้อมกับเสื้อมหาวิทยาลัยขณะที่เดินในห้างสรรพสินค้าพร้อมกับญาติและแอบถ่ายภาพของนักศึกษารุ่นน้องลงบนเฟซบุ๊กส่วนตัว[13][14] ซึ่งญาติของนักศึกษารุ่นน้องได้แจ้งความต่อนักศึกษารุ่นพี่ดังกล่าว[15]