เจ้าชายฟรันทซ์-โยเซ็ฟแห่งบาวาเรีย (อังกฤษ: Prince Franz-Josef of Bavaria) ประสูติเมื่อวันที่ 21 กันยายน 2500 เป็นพระโอรสลำดับที่ 2 และพระองค์แรกใน เจ้าชายรัสโซแห่งบาวาเรีย และ เจ้าหญิงเตเรซาแห่งบาวาเรีย พระองค์ไม่ทรงเสกสมรส จึงไม่มีพระบุตร โดยปัจจุบันพระองค์ทรงงานในด้านของโบสถ์ออสติน อาลาดอกก์ ซึ่งอยู่ทางตอนใต้ของบาวาเรีย จนกระทั่งปี 2539 พระองค์ทรงย้ายไปประทับในแทนซาเนีย ปัจจุบันพระองค์ทรงงานในด้านของนักบุญในประเทศเคนยาเจ้าชายฟรันทซ์-โยเซ็ฟแห่งบาวาเรีย ทรงอยู่ในลำดับที่ 6 ในการสืบทอดตำแหน่ง ดยุกแห่งบาวาเรีย