วิวัฒนาการชาติพันธุ์ ของ RacCS203

ต้นไม้สายวิวัฒนาการ

ต้นไม้สายวิวัฒนาการจัดเรียงบนพื้นฐานของลำดับจีโนมทั้งหมดของสายพันธุ์ SARS-CoV-2 และไวรัสโคโรนาที่เกี่ยวข้องคือ:[3][4][5]

SARS-CoV-2 related coronavirus

Rc-o319, 81% เหมือนกับ SARS-COV-2, Rhinolophus cornutus, อิวาเตะ, ญี่ปุ่น[6]





SL-ZXC21, 88% เหมือนกับ SARS-COV-2, Rhinolophus pusillus, โจวชาน, เจ้อเจียง, จีน[7]



SL-ZC45, 88% เหมือนกับ SARS-COV-2, Rhinolophus pusillus, โจวชาน, เจ้อเจียง, จีน[7]





Pangolin SARSr-COV-GX, 89% เหมือนกับ SARS-COV-2, Manis javanica, ลักลอบค้าสัตว์ป่าในเอเชียตะวันออกเฉียงใต้[8]




Pangolin SARSr-COV-GD, 91% เหมือนกับ SARS-COV-2, Manis javanica, ลักลอบค้าสัตว์ป่าในเอเชียตะวันออกเฉียงใต้[9]





RshSTT182, 92.6% เหมือนกับ SARS-COV-2, Rhinolophus shameli, สตึงแตรง, กัมพูชา[5]



RshSTT200, 92.6% เหมือนกับ SARS-COV-2, Rhinolophus shameli, สตึงแตรง, กัมพูชา[5]





RacCS203, 91.5% เหมือนกับ SARS-COV-2, Rhinolophus acuminatus, ฉะเชิงเทรา, ไทย[4]



RmYN02, 93.3% เหมือนกับ SARS-COV-2, Rhinolophus malayanus เมืองล้า, ยูนนาน, จีน[10]




RpYN06, 94.4% เหมือนกับ SARS-COV-2, Rhinolophus pusillus, สิบสองปันนา, ยูนนาน, จีน[3]




RaTG13, 96.1% เหมือนกับ SARS-COV-2, Rhinolophus affinis, โม่เจียง, ยูนนาน, จีน



SARS-CoV-2









SARS-CoV-1, 79% เหมือนกับ SARS-COV-2


การเปรียบเทียบจีโนม

SARS-CoV-2 เปรียบเทียบกับสายพันธุ์ SARSr-CoV อื่น (โดย % นิวคลิโอไทด์)[11]
สายพันธุ์ลำดับเบสทั้งจีโนมORF1abSRBMORF3aEMORF6ORF7aORF7bORF8NORF10
RaTG1396.10%96.50%92.30%86.30%96.30%99.60%95.50%98.40%95.60%99.20%97.00%96.90%99.20%
RmYN0293.60%97.10%72.50%61.90%96.40%98.70%94.80%96.80%96.20%91.00%48.70%97.30%99.20%
RacCS20391.50%94.30%71.30%61.60%91.90%99.10%94.60%96.20%92.40%93.90%91.60%93.20%99.20%
GD/1/201990.20%90.20%83.70%86.90%93.20%99.10%93.30%95.70%93.40%91.70%92.10%96.20%99.20%
SL-ZC4587.70%89.00%75.50%62.50%87.80%98.70%93.40%94.60%88.80%94.70%88.50%91.10%99.20%
SL-ZXC2187.50%88.70%74.90%61.60%88.90%98.70%93.40%94.60%89.10%95.50%88.50%91.20%99.20%
GX-P4L85.40%84.80%83.60%80.00%86.80%97.40%91.30%90.90%86.60%83.50%81.30%91.00%88.90%
GX-P5L85.20%84.60%83.30%79.90%87.00%97.40%91.30%90.90%86.40%83.50%80.70%91.00%94.00%
SARS-CoV79.30%79.70%72.30%71.90%75.30%93.50%85.50%75.50%82.10%83.80%45.80%88.20%93.20%
Rc-o31979.20%79.80%72.20%70.10%83.30%97.40%86.60%86.60%78.40%77.30%52.30%88.30%94.90%
SARS-CoV-2 เปรียบเทียบกับสายพันธุ์ SARSr-CoV อื่น (โดย % กรดอะมิโน)[11]
สายพันธุ์ลำดับเบสทั้งจีโนมORF1abSRBMORF3aEMORF6ORF7aORF7bORF8NORF10
RaTG1398.50%97.30%90.10%97.80%100.00%99.60%100.00%97.50%97.70%95.00%99.10%97.40%
RmYN0298.80%72.40%63.20%96.70%100.00%98.70%96.70%95.90%83.70%28.20%98.60%97.40%
RacCS20397.30%72.30%63.70%97.50%100.00%99.10%98.40%95.90%93.00%94.20%95.70%-
GD/1/201996.70%90.00%96.90%97.10%100.00%98.70%96.70%97.50%95.40%95.00%97.90%97.40%
SL-ZC4595.60%80.20%65.90%90.90%100.00%98.70%93.40%87.60%93.00%94.20%94.30%97.40%
SL-ZXC2195.20%79.70%65.90%92.00%100.00%98.70%93.40%88.40%93.00%94.20%94.30%-
GX-P4L92.50%92.30%86.60%89.50%100.00%98.20%95.10%88.40%-87.60%93.60%73.70%
GX-P5L92.50%92.40%86.60%89.80%100.00%98.20%95.10%88.40%72.10%87.60%93.80%84.20%
SARS-CoV86.10%75.80%73.10%72.40%94.70%90.50%67.20%85.30%81.40%-90.50%81.60%
Rc-o31987.60%76.20%73.50%87.00%98.70%91.00%83.60%73.80%69.80%26.80%89.50%86.80%