กกขนากมีชื่อพ้องหลายชื่อ[5] รวมถึงในประเทศไทยมีการเรียกชื่อแตกต่างกันในแต่ละที่[4] ดังนี้

• ชื่อพ้อง
  • Cyperus difformis var. breviglobosus (Kük., 1936)
  • Cyperus difformis forma humilis (Debeaux, 1876)
  • Cyperus difformis forma maximus (C.B.Clarke, 1884)
  • Cyperus difformis var. subdecompositus (Kük., 1936)
  • Cyperus goeringii (Steud., 1854)
  • Cyperus holoschoenoides (Jan ex Schult., 1824)
  • Cyperus lateriflorus (Torr., 1858)
  • Cyperus oryzetorum (Steud., 1854)
  • Cyperus protractus (Link, 1821)
  • Cyperus subrotundus (Llanos, 1851)
  • Cyperus viridis (Willd. ex Kunth, 1837)
• ชื่อท้องถิ่น
  • ดอกต่อ - ภาคเหนือ
  • หญ้าขนหมู - ภาคเหนือ
  • ผือน้อย - ภาคตะวันออกเฉียงเหนือ