สถาบันการบริหารอิสระ (ญี่ปุ่น: 独立行政法人; โรมาจิ: Dokuritsu Gyōsei Hōjin) ภายใต้การกำกับดูแลของกระทรวงการคลังได้แก่:

• กองกษาปณ์ญี่ปุ่น
• สำนักงานการพิมพ์แห่งชาติ
• สถาบันการวิจัยการกลั่นเบียร์แห่งชาติ
• บริษัทนิปปอนระบบยกเว้นภาษีสินค้าอัตโนมัติจำกัด
• องค์กรพิเศษในโอกาสงานนิทรรศการโลก พ.ศ. 2513
• สำนักงานการเงินเพื่อการเคหะญี่ปุ่น