กระทรวงทหารเรือสหรัฐ (อังกฤษ: United States Department of the Navy ตัวย่อ: DoN) เป็นอีกหนึ่งหน่วยงานของกระทรวงกลาโหมสหรัฐ จัดตั้งขึ้นโดยพระราชบัญญัติ Act of Congress เมื่อวันที่ 30 เมษายน พ.ศ. 2341 (ซึ่งได้ริเริ่มโดยคำแนะนำของเจมส์ แม็คเฮนรี่)[1] เพื่อให้เป็นโครงสร้างองค์กรของรัฐบาลต่อกองทัพเรือสหรัฐ นาวิกโยธินสหรัฐจากปี พ.ศ. 2377 เป็นต้นมา[2]จนถึงปีพ.ศ. 2492 เมื่อมีการแก้ไขพระราชบัญญัติความมั่นคงแห่งชาติของปีพ.ศ. 2490 ได้เปลี่ยนให้เป็นแห่งชาติให้เป็นกระทรวงกลาโหม กระทรวงทหารเรือสหรัฐก็กลายเป็นส่วนหนึ่งในกระทรวงกลาโหม ภายใต้อำนาจทิศทางและการควบคุมของกระทรวงกลาโหม