ในปี พ.ศ. 2490 เมื่อครั้งที่พลเรือเอก หลวงสินธุสงครามชัย (สินธุ์ กมลนาวิน) ดำรงตำแหน่งผู้บัญชาการทหารเรือ ได้มีการจัดซื้อยานพาหนะสะเทินน้ำสะเทินบกจากประเทศฟิลิปปินส์ โดยจัดซื้อแอลวีที-4 ที่เหลือใช้จากสงครามโลกครั้งที่สอง 12 คัน และรถฮาล์ฟแทร็คอีก 9 คัน แล้วลำเลียงโดยเรือหลวงอ่างทอง (USS LST-924) มาเก็บไว้ที่กองพาหนะ สถานีทหารเรือสัตหีบ นอกจากนี้ ได้มีการจัดซื้อรถสายพานเพิ่มอีกในปี พ.ศ. 2492

ครั้นวันที่ 29 มิถุนายน พ.ศ. 2494 จากเหตุการณ์กบฏแมนฮัตตัน ได้ทำให้กองทัพเรือต้องประสบความสูญเสียอย่างมาก เนื่องด้วยรถชนิดต่าง ๆ ที่สั่งซื้อมาตั้งแต่ปี พ.ศ. 2490 ถูกยึดและทำลายเกือบทั้งหมด ยกเว้นแอลวีที-4 ซึ่งปล่อยทิ้งไว้ในป่าควินิน ณ กองพาหนะ สถานีทหารเรือสัตหีบ

กระทั่งปี พ.ศ. 2496 รัฐบาลของจอมพล ป.พิบูลสงคราม ได้เซ็นสัญญาโครงการความช่วยเหลือทางทหารกับสหรัฐ ซึ่งกองทัพเรือได้เริ่มปรับปรุงกำลังนาวิกโยธิน โดยมีที่ปรึกษาจัสแมกมาประจำอยู่ที่กรม ต่อมา นาวาเอก สนอง นิสาลักษณ์ ผู้บัญชาการหน่วยบัญชาการนาวิกโยธิน (ยศในขณะนั้น) ได้เล็งเห็นความสำคัญของแอลวีที-4 ที่มีอยู่ จึงได้ของบประมาณจากกองทัพเรือ เพื่อปรับปรุงซ่อมแซมแอลวีที-4 ไว้ใช้ในราชการ

วันที่ 9 มิถุนายน ของปีดังกล่าว ได้มีการจัดตั้ง "หน่วยอบรมสะเทินน้ำสะเทินบก" ซึ่งมีว่าที่เรือตรี สุจิตต์ บุนนาค เป็นผู้บังคับหน่วย และปรับปรุงซ่อมแซมแอลวีที-4 จนสามารถใช้ในราชการได้ 14 คัน ซึ่งวันที่ 9 มิถุนายนนี้เอง ที่กองพันรถสะเทินน้ำสะเทินบก กองพลนาวิกโยธิน ถือเป็นวันสถาปนาหน่วยจนถึงปัจจุบัน

ครั้นปี พ.ศ. 2497 ได้จัดตั้งเป็น "หมวดรถสะเทินน้ำสะเทินบก" ก่อนที่จะยกฐานะขึ้นเป็น "กองร้อยรถขึ้นบก" ในปี พ.ศ. 2500 แล้วจึงยกฐานะเป็น "กองรถสะเทินน้ำสะเทินบก" ในวันที่ 10 สิงหาคม พ.ศ. 2522

เนื่องด้วยสมัยก่อนต้องใช้เรือในการนำกำลังนาวิกโยธินเข้ายึดหัวหาด ทำให้มีการสูญเสียนาวิกโยธินเป็นจำนวนมาก ทางหน่วยจึงได้จัดซื้อยานรบสะเทินน้ำสะเทินบก 21 คันจากสหรัฐ เพื่อป้องกันการถูกโจมตีบนหาด และสามารถเคลื่อนที่ได้อย่างรวดเร็ว โดยยานรบสะเทินน้ำสะเทินบกแบบเอเอวี-7เอ1 สามารถลำเลียงทหารพร้อมอาวุธยุทโธปกรณ์เพื่อยกพลขึ้นบกได้ 25 นาย และมีรัศมีการรบไกลฝั่งแผ่นดินของข้าศึก[2]

วันที่ 1 เมษายน พ.ศ. 2532 หน่วยได้แปรสภาพเป็น "กองพันรถสะเทินน้ำสะเทินบก กองพลนาวิกโยธิน" จากนั้น ในวันที่ 4 เมษายน พ.ศ. 2534 ได้ย้ายที่ตั้งหน่วยมายังตำบลพลูตาหลวง อำเภอสัตหีบ จังหวัดชลบุรี