ตัวอย่างที่การแบ่งกลุ่มข้อมูลแบบเคมีนลู่เข้าถึงค่าต่ำสุดเฉพาะที่ ในตัวอย่างนี้ผลลัพธ์ของการแบ่งกลุ่มแบบเคมีน (รูปขวาสุด) ขัดแย้งกับรูปแบบของกลุ่มข้อมูลที่สามารถเห็นได้อย่างชัดเจนจากภาพ วงกลมเล็กแทนถึงจุดข้อมูลแต่ละจุด ดาวสี่แฉกแทนถึงจุดศูนย์กลางของกลุ่มข้อมูลแต่ละกลุ่ม รูปแบบของกลุ่มข้อมูลเริ่มต้นแสดงในรูปด้านซ้ายสุด อัลกอริธึมลู่เข้าหลังจากการวนซ้ำรอบที่ 5 (จากภาพซ้ายไปขวา)การแบ่งกลุ่มแบบเคมีน (k-means clustering) และการแบ่งกลุ่มแบบ EM (EM clustering) ของกลุ่มข้อมูล ("mouse"). ผลลัพธ์ของการแบ่งกลุ่มข้อมูลแบบเคมีนสร้างกลุ่มข้อมูลที่มีขนาดเท่ากัน ทำให้ผลลัพธ์ออกมาอย่างไม่เหมาะสม ในขณะที่การแบ่งกลุ่มแบบ EM ให้ผลลัพธฺ์ที่ดีกว่าเนื่องจากใช้การจัดแจงแบบปรกติที่แสดงให้เห็นในเซ็ตข้อมูล

องค์ประกอบสองอย่างที่ทำให้การแบ่งกลุ่มแบบเคมีนเป็นอัลกอริธึมที่มีประสิทธิภาพ แต่ก็มักจะถูกพิจารณว่าเป็นข้อเสียของการแบ่งกลุ่มแบบเคมีนได้แก่:

• ระยะทางแบบยูคลิดได้ถูกใช้ให้เป็นตัววัดระยะห่างระหว่างข้อมูลและความแปรปรวน (Variance) ถูกใช้เป็นตัววัดการกระจ่ายของกลุ่มข้อมูล
• จำนวนของกลุ่มของข้อมูล k เป็นตัวแปรเสริมที่ถูกนำเข้าในอัลกอริธึม: ตัวเลือกที่ไม่เหมาะสมสำหรับค่าของ k อาจจะส่งผลให้ผลลัพธ์ที่ออกมาไม่ดีนัก ดังนั้นการตรวจสอบจำนวนของกลุ่มข้อมูลที่เหมาะสมต่อข้อมูลจึงเป็นสิ่งที่สำคัญอย่างยิ่งก่อนจะเริ่มดำเนินการแบ่งกลุ่มแบบเคมีน
• การลู่เข้าถึงค่าต่ำสุดเฉพาะที่ (local minimum) อาจส่งผลให้อัลกอริธึมมอบผลลัพธ์ที่ผิดพลาดได้

ปัจจัยที่จำกัดความสามารถของการแบ่งกลุ่มแบบเคมีนคือโมเดลของกลุ่มข้อมูล การแบ่งกลุ่มของข้อมูลแบบเคมีนคาดการณ์โมเดลของกลุ่มข้อมูลเป็นรูปแบบของทรงกลม และข้อมูลสามารถถูกแบ่งกลุ่มได้โดยการที่ค่าเฉลี่ยของกลุ่มข้อมูลลู่เข้า ถึงจุดศูนย์กลางของกลุ่มข้อมูลทรงกลมนั้น กลุ่มข้อมูลแต่ละกลุ่มถูกคาดการณ์ไว้ว่าจะมีขนาดที่ใกล้เคียงกัน ทำให้การกำหนดกลุ่มของข้อมูลแต่ละตัวไปยังจุดศูนย์กลางของกลุ่มข้อมูลที่อยู่ใกล้ที่สุดถูกต้อง ซึ่งปัจจัยเหล่านี้ก่อให้เกิดปัญหาในการแบ่งกลุ่มแบบเคมีน ต่อกลุ่มข้อมูลที่มีลักษณะไม่ตรงไปตามความคาดการณ์ที่ถูกกำหนดไว้ในอัลกอริธึม

เราสามารถมองผลลัพธ์ของการแบ่งกลุ่มแบบเคมีนได้ในรูปแบบของแผนภาพโวโรนอยของค่าเฉลี่ยกลุ่มข้อมูล เนื่องจากข้อมูลถูกแบ่งครึ่งทางระหว่างระยะห่างของจุดศุนย์กลางของกลุ่มข้อมูลแต่ละกลุ่ม ดังนั้นจึงอาจจะทำให้เกิดการแบ่งข้อมูลที่ไม่เหมาะสมอย่างที่สุดได้ (ดูตัวอย่างใน กลุ่มข้อมูล "mouse") การแจกแจงแบบปรกติ (The Gaussian model)ซึ่งใช้โดย Expectation-maximization (EM) อัลกอริธึม มีความยึดหยุ่นในการแบ่งข้อมูลเนื่องจากมีการคำนวณโดยใช้ทั้งการแปรปรวนและการแปรปรวนร่วมเกี่ยว ส่งผลให้สามารถแบ่งกลุ่มข้อมูลที่มีขนาดแตกต่างกันในแต่ละกลุ่มได้ดีกว่าการแบ่งกลุ่มแบบเคมีน