จอน กินเลียน พนักงานบริษัทที่ใช้ชีวิตที่ราบเรียบธรรมดา ในวันหยุดที่แสนจะน่าเบื่อหน่ายเขาได้ถูกหู่นรับใช้ที่แสนจะน่าเบื่อหน่ายปลุกแต่เช้าแต่เนื่องด้วยเป็นวันหยุดเขาจึงเข้าไปในร้านแห่งความฝันหรือดรีมเมคเกอร์ ซึ่งในร้านลูกค้าสามารถเลือกวิดีโอหนังเรื่องที่ตัวเองต้องการจะเป็นพระเอกแล้วไปนอนให้เครื่องกระตุ้นฝันทำงาน เนื่องจากจอน กินเลียน มีความต้องการหลายอย่าง อยากเป็นคาวบอย อยากท่องอวกาศ อยากมีฮาเลมส่วนตัวพนักงานสาวสวยที่บริการจึงตัดสินใจนำม้วนวิดิโอหลายๆเรื่องมาผสมกันและได้ฝันไปว่าเขาคือสุดยอดสลัดอวกาศที่มีแขนซ้ายเป็นปืนไซโคกันและได้เกิดต่อสู้กับกัปตันไบเคนซึ่งเป็นสลัดสมุนของกิลโด้ถูกเขายิงตาซ้ายบอด ผลที่ได้จึงเป็นการฟื้นความทรงจำของเจ้าตัวแต่ว่าจอน กินเลียน เองยังไม่รู้ตัว และกลับออกจากร้านมาด้วยความสบายใจหลังจากนั้น จอน กินเลียน จึงไปเล่นคาสิโนต่อแต่ว่าเจ้าหน้าที่ที่คาสิโนเห็นว่าเขาเล่นได้มากจึงต้องการเก็บเขาซะจึงได้เชิญลงไปที่ห้องใต้ดินที่นั่นเขาได้พบกับ ลุกน้องของกิลเดอร์ที่มีนกอีกาหุ่นยนต์ข้างกายตลอดเวลา จึงได้เอ่ยปากทักไปอย่างไม่ตั้งใจ "กัปตันไบเคน" ซึ่งทำเอาคนที่เขาทักถึงกลับเงื่อแตกเพราะว่าไม่น่าจะมีใครรู้จักเขานอกจาก คอบร้าที่มีมือซ้ายเป็นปืนไซโคกัน เขาจึงแกล้งบอกไปว่าเขาไม่ใช่ และด้วยไหวพริบและทักษะการต่อสู้ที่ตัว จอน กินเลียน เองยังทึ่งเขาได้เอาตัวรอดมาจากคาสิโนได้ กัปตันไบเคนรู้ถึงการหลบหนีของจอน กินเลียน จึงออกติดตามเพื่อจะกำจัดคนที่รู้ตัวจริงของเขา ในที่สุด จอน กินเลียน ก็ได้ยิงไซโคกันออกไปด้วยความไม่ตั้งใจทำให้ไบเคนจำได้ว่า จอน กินเลียน คือใคร แต่ก็เสียชีวิต จอน กินเลียน จึงได้หนีกลับอพาร์ทเมนของเขาอย่างรวดเร็วแต่ทว่าเหตุการทั้งหมดได้ถูกส่งไปที่กองกำลังของกิลล์เดอร์แล้วด้วยกล้องที่ลูกนัยตาของนกกาหุ่นยนต์คู่หูของไบเคนข่าวนี้ถูกส่งไปยังองค์กรกิลโด้ซึ่งขณะนี่คริสตัลบอยที่ร่างกายเป็นคริสตัสโปร่งแสง ลูกน้องคนสำคัญ ของกิลล์เดอร์ จอน กินเลียน ที่กำลังสับสนเรื่องของตัวเองค่อยๆนึกเรื่องของเขาเองทีละน้อย ในขณะเดียวกันที่กองกำลังของกลิล์เดอร์มาปิดล้อมเขาและได้ยิงปืนเลเซอร์ใส่เขา หุ่นรับใช้ที่แสนน่าเบื่อของเขาจึงรับลุกกระสุนแทนเจ้านาย ขณะนั้นเองที่จอนท์ รู้ว่าเขาคือสลัดที่เคยปล้นไปทั่วจักรวาลและท่องเที่ยวอย่างอิสระ จนต่อมาองค์กรกิลโด้ครองจักรวาล ได้ต้อนเหล่าสลัดอวกาศเข้าสังกัด แต่เขาไม่ยินยอม เขาจึงถูกกิลโด้ล่าสังหาร สุดท้ายถูกคริสตัลบอยที่คอนนั้นยังเป็นมนุษย์ฟันแขนซ้ายขาด และเลดี้คนรักของเขาก็เสียชีวิต คริสตัลบอยเองก็ตายไปด้วย จากนั้นเขาจึงได้กลับไปยังโลก และให้ ดร.คนหนึ่งสร้างปืนไซโคกันให้ และสร้างอาเมอร์รอยเลดี้ ขึ้นมา จากนั้นเขาก็ออกไปต่อสู้กับกิลโด้ด้วยความแค้น แต่ด้วยกองกำลังของกิลโด้ที่มีจำนวนนับไม่ถ้วน ทำให้คอบร้ารู้สึกเบื่อหน่ายต่อการต่อสู้ จึงได้ตัดสินใจผ่าตัดเปลี่ยนแปลงใบหน้าและลบความทรงจำ หลบไปใช้ชีวิตอย่างคนธรรมดาในดวงดาวสุดขอบจักรวาล ทำงานเป็นพนักงานบริษัทหาเลี้ยงชีวิต เขาจึงต่อสู้กับลูกสมุนของกิลล์เดอร์เพื่อจะหนีออกไปด้วยความที่เขาไม่ได้ต่อสู้มานานจึงเสียท่าจนได้ แต่ก่อนที่ทุกอย่างจะสายเกินไปมีหุ่นอาร์เมอร์ลอยก้าวออกมาจาซากหุ่นยนต์รับใช้ มาเลดี้ซึ่งแฝงตัวอยู่ในหุ่นรับใช้นั่นเอง ทั้ง 2กำจัดลูกน้องของกิลล์เดอร์จนหมดแล้ว เขาก็นำแขนเทียมกับปืนคู่ใจของเขาออกมาจากหลังบานกระจกที่เขาส่องหน้าอยู่ทุกวันมาหลายปีแล้วเอ่ยกับเลดี้ ไปกันเถอะ เลดี้จึงตอบไปว่า ตกลง "คอบร้า" ทั้ง 2 ได้หาเงินซี้ออยานอวกาศลำเก่าๆเพื่อไปหายานเตอร์เติลที่อยู่ที่ดาวอีกดวง แล้วการเดินทางออกสู่อวกาศของชายที่เป็นสลัดอวกาศที่มีค่าหัวที่มากที่สุดในจักวาล ชายที่มีแขนซ้ายเป็นไซโคกันเพื่อต่อสู้กับกิลโด้ ในนาม"คอบร้า"ก็เริ่มขึ้นอีกครั้ง

คอบร้าถูกชักนำให้เข้าไปร่วมกับสงครามหลากหลายรูปแบบ และพบว่าแต่ละที่ต่างมีเงาขององค์กรกิลล์ ชักใยอยู่เบื้องหลังเกือบทั้งสิ้น เขาได้พบกับมิตรสหายใหม่ๆ ที่มีบทบาทในการโค่นล้มองค์กรกิลล์ และคริสตัลบอย คือ มิสตรี้ หงอคง กัปตันดอว์สัน และในที่สุดเขาก็จบฝันร้ายอันยาวนานลงได้ และเดินทางท่องเที่ยวอย่างสำราญในอีกหลายตอนต่อจากนั้น