​I Wish เป็นเรื่องราวของสองพี่น้อง ​โคอิจิ ผู้เป็นพี่ และ ริวโนะสุเกะ ผู้เป็นน้อง ที่ครอบครัวจากเดิมที่เคยอยู่ด้วยกันกลับต้องมาพลัดพรากจากกันไปอยู่คนละเมืองเพราะพ่อแม่ของพวกเขาหย่าร้างกัน โดยโคอิจิ พี่ชายคนโตต้องไปอยู่กับ โนโซมิ ผู้เป็นแม่ที่บ้านของคุณตาและคุณยายที่จังหวัดคาโงชิมะ​ ส่วน ริวโนะสุเกะ ต้องไปอยู่กับ เคนจิ ผู้เป็นพ่อที่เป็นนักดนตรีที่จังหวัดฟูกูโอกะ​ ถึงแม้ว่าพี่น้องทั้งสองคนจะต้องอยู่ห่างไกลกันแต่ก็ยังติดต่อกันทางโทรศัพท์อยู่เสมอ

ในจังหวัดคาโงชิมะที่โคอิจิอาศัยอยู่นั้นกำลังจะเปิดการเดินรถไฟชิงกันเซ็ง​เส้นทางใหม่ โดยโคอิจิได้ยินข่าวลือในชั้นเรียนวิชาวิทยาศาสตร์ว่า เมื่อรถไฟชิงกันเซ็นสายซากุระที่วิ่งด้วยความเร็ว 260 กิโลเมตร/ชั่วโมง จากสถานีคาโงชิมะ และรถไฟชิงกันเซ็นสายสึบาเมะที่วิ่งด้วยความเร็ว 260 กิโลเมตร/ชั่วโมง จากสถานีฮากาตะ ทั้งสองขบวนวิ่งสวนกันจะบังเกิดพลังงานมหาศาลที่ทำให้เกิดปาฏิหาริย์ขึ้น โดยผู้ที่เห็นรถไฟสวนกันสิ่งที่ปรารถนาจะเป็นความจริง

เมื่อโคอิจิได้ยินเรื่องดังกล่าวจึงทำการหาจุดที่รถไฟทั้งสองสายจะวิ่งสวนกัน และพบว่ารถไฟทั้งสองสายจะวิ่งสวนกันที่เมืองคูมาโมโตะ​