จังหวัดยามานาชิประกอบด้วย 13 เมือง 5 อำเภอ 10 ตำบล และ 4 หมู่บ้าน ได้แก่

เมือง

• โคชู (ญี่ปุ่น: 甲州市 โรมาจิ: Kōshū-shi)
• โคฟุ (ญี่ปุ่น: 甲府市 โรมาจิ: Kōfu-shi) (เมืองเอก)
• ไค (ญี่ปุ่น: 甲斐市 โรมาจิ: Kai-shi)
• ชูโอ (ญี่ปุ่น: 中央市 โรมาจิ: Chūō-shi)
• นิราซากิ (ญี่ปุ่น: 韮崎市 โรมาจิ: Nirasaki-shi)
• ฟูจิโยชิดะ (ญี่ปุ่น: 富士吉田市 โรมาจิ: Fujiyoshida-shi)
• ฟูเอฟูกิ (ญี่ปุ่น: 笛吹市 โรมาจิ: Fuefuki-shi)
• มินามิแอลป์ (ญี่ปุ่น: 南アルプス市 โรมาจิ: Minami'arupusu-shi)
• ยามานาชิ (ญี่ปุ่น: 山梨市 โรมาจิ: Yamanashi-shi)
• สึรุ (ญี่ปุ่น: 都留市 โรมาจิ: Tsuru-shi)
• อูเอโนฮาระ (ญี่ปุ่น: 上野原市 โรมาจิ: Uenohara-shi)
• โอตสึกิ (ญี่ปุ่น: 大月市 โรมาจิ: Ōtsuki-shi)
• โฮกูโตะ (ญี่ปุ่น: 北杜市 โรมาจิ: Hokuto-shi)

อำเภอ ตำบล และหมู่บ้าน

• อำเภอคิตะสึรุ (ญี่ปุ่น: 北都留郡 โรมาจิ: Kitatsuru-gun)
  • หมู่บ้านโคซูเงะ (ญี่ปุ่น: 小菅村 โรมาจิ: Kosuge-mura)
  • หมู่บ้านทาบายามะ (ญี่ปุ่น: 丹波山村 โรมาจิ: Tabayama-mura)
• อำเภอนากะโกมะ (ญี่ปุ่น: 中巨摩郡 โรมาจิ: Nakakoma-gun)
  • ตำบลโชวะ (ญี่ปุ่น: 昭和町 โรมาจิ: Shōwa-chō)
• อำเภอนิชิยัตสึชิโระ (ญี่ปุ่น: 西八代郡 โรมาจิ: Nishiyatsushiro-gun)
  • ตำบลอิจิกาวามิซาโตะ (ญี่ปุ่น: 市川三郷町 โรมาจิ: Ichikawamisato-chō)
• อำเภอมินามิโกมะ (ญี่ปุ่น: 南巨摩郡 โรมาจิ: Minamikoma-gun)
  • ตำบลนัมบุ (ญี่ปุ่น: 南部町 โรมาจิ: Nanbu-chō)
  • ตำบลฟูจิกาวะ (ญี่ปุ่น: 富士川町 โรมาจิ: Fujikawa-chō)
  • ตำบลมิโนบุ (ญี่ปุ่น: 身延町 โรมาจิ: Minobu-chō)
  • ตำบลฮายากาวะ (ญี่ปุ่น: 早川町 โรมาจิ: Hayakawa-chō)
• อำเภอมินามิสึรุ (ญี่ปุ่น: 南都留郡 โรมาจิ: Minamitsuru-gun)
  • ตำบลนิชิกัตสึระ (ญี่ปุ่น: 西桂町 โรมาจิ: Nishikatsura-chō)
  • ตำบลฟูจิกาวางูจิโกะ (ญี่ปุ่น: 富士河口湖町 โรมาจิ: Fujikawaguchiko-machi)
  • หมู่บ้านโดชิ (ญี่ปุ่น: 道志村 โรมาจิ: Dōshi-mura)
  • หมู่บ้านนารูซาวะ (ญี่ปุ่น: 鳴沢村 โรมาจิ: Narusawa-mura)
  • หมู่บ้านยามานากาโกะ (ญี่ปุ่น: 山中湖村 โรมาจิ: Yamanakako-mura)
  • หมู่บ้านโอชิโนะ (ญี่ปุ่น: 忍野村 โรมาจิ: Oshino-mura)