ในอดีต จังหวัดอิวาเตะ เป็นส่วนหนึ่งของอดีตจังหวัดมุตสึ (陸奥国 Mutsu no kuni) ซึ่งมีประวัติศาสตร์ยาวนานกว่า 800 ปี ในยุคโจมง (縄文時代 Jōmon jidai) บริเวณนี้เป็นพื้นที่ประมงและล่าสัตว์ นอกจากนี้ยังเคยเป็นถิ่นอาศัยของชนเผ่าเอมิชิ (蝦夷 Emishi) อันเป็นชนเผ่าโบราณที่อาศัยอยู่ในภูมิภาคโทโฮกุ จนกระทั่งสิ้นสุดคริสต์ศตวรรษที่ 8 เมื่ออิทธิพลของขุนนางในยุคนาระ (奈良時代 Nara-jidai) แพร่ขยายมาถึง โดยมีหลักฐานคือป้อมชิวะ ที่สร้างในปี ค.ศ. 803 บริเวณทางด้านเหนือของเมืองโมริโอกะในปัจจุบัน

เมื่อวันที่ 14 มิถุนายน ค.ศ. 2008 เกิดเหตุการณ์แผ่นดินไหวบริเวณจังหวัดอิวาเตะและจังหวัดมิยางิ มีความรุนแรงถึงแมกนิจูด 7.2

ในเหตุแผ่นดินไหวและคลื่นสึนามิวันที่ 11 มีนาคม พ.ศ. 2554 จังหวัดอิวาเตะซึ่งตั้งอยู่ในบริเวณที่เกิดธรณีพิบัติภัยก็ได้รับความเสียหายอย่างหนักเช่นกัน