ตำบลหนองกอมเกาะแบ่งออกเป็น 11 หมู่บ้าน ดังนี้

1. หมู่ที่ 1 บ้านดอนดู่ (Ban Don Du)
2. หมู่ที่ 2 บ้านนาไก่ (Ban Na Kai)
3. หมู่ที่ 3 บ้านคุยนางขาว (Ban Khui Nang Khao)
4. หมู่ที่ 4 บ้านนาเหลาทอง (Ban Na Lao Thong)
5. หมู่ที่ 5 บ้านนาทา (Ban Na Tha)
6. หมู่ที่ 6 บ้านโนนธาตุ (Ban Non That)
7. หมู่ที่ 7 บ้านหนองเดิ่น (Ban Nong Doen)
8. หมู่ที่ 8 บ้านแจ้งสว่าง (Ban Chaeng Sawang)
9. หมู่ที่ 9 บ้านหนองกอมเกาะ (Ban Nong Kom Ko)
10. หมู่ที่ 10 บ้านหนองขาม (Ban Nong Kham)
11. หมู่ที่ 11 บ้านศรีเจริญ (Ban Si Charoen)