ทางหลวงแผ่นดินหมายเลข 1290 แบ่งเขตการควบคุมออกเป็น 2 ตอน ดังนี้

• ตอน 0101 แม่สาย–กิ่วกาญจน์ จากกิโลเมตรที่ 0+000 ถึงกิโลเมตรที่ 74+167 ระยะทาง 74.167 กิโลเมตร อยู่ภายใต้การควบคุมของหมวดทางหลวงเชียงแสน แขวงทางหลวงเชียงรายที่ 2
• ตอน 0102 กิ่วกาญจน์–เชียงของ จากกิโลเมตรที่ 74+167 ถึงกิโลเมตรที่ 93+027 ระยะทาง 18.860 กิโลเมตร อยู่ภายใต้การควบคุมของหมวดทางหลวงเชียงของ แขวงทางหลวงเชียงรายที่ 2