ท่าอากาศยานนราธิวาสตั้งอยู่ริมทางหลวงแผ่นดินหมายเลข 4136 (นราธิวาส-บ้านทอน) โดยมีลานจอดรถยนต์ทั้งหมด 8 ลานจอด สามารถจุรถยนต์ได้ประมาณ 350 คัน โดยแบ่งเป็น 2 ประเภท คือ

1. ลานจอดรถชั่วคราว (ระยะเวลาจอดไม่เกิน 1 คืน) บริเวณลานจอด 1, 2, 5, 6, 7, 8 สำหรับทั้งเจ้าหน้าที่และผู้มารับ-ส่งผู้โดยสาร
2. ลานจอดรถค้างคืน (ระยะเวลาจอดตั้งแต่ 1 คืนขึ้นไป) บริเวณลานจอด 3 - 4 โดยผู้ประสงค์จอดรถค้างคืนต้องปฏิบัติตามระเบียบข้อปฏิบัติดังนี้

• จอดรถไว้ในช่อง 3 และ 4 ของลานจอดรถ
• แจ้งเจ้าหน้าที่ท่าอากาศยานนราธิวาสและลงทะเบียนฝากรถ ที่จุดลงทะเบียนจอดรถค้างคืน บริเวณด้านหน้าประตูทางออกอาคารที่พักผู้โดยสาร โดยยื่นบัตรประจำตัวประชาชนทุกครั้ง
• กรณีรับรถที่จอดค้างคืน โปรดแจ้งเจ้าหน้าที่ท่าอากาศยานนราธิวาสและลงทะเบียนรับรถ ที่จุดลงทะเบียนจอดรถค้างคืน บริเวณด้านหน้า ประตูทางออกอาคารที่พักผู้โดยสาร ทุกครั้ง

• หมายเหตุ - ไม่มีค่าบริการในการจอดรถค้างคืน และท่าอากาศยานนราธิวาสไม่รับผิดชอบกรณีรถของท่านเกิดความเสียหายจากภัยพิบัติทุกกรณี[7]

บริการรถรับ-ส่ง

ท่าอากาศยานนราธิวาส ยังไม่มีบริการรถประจำทาง (รถสองแถว) แต่มีบริการรถรีมูซีนรับ-ส่งผู้โดยสาร ตามเส้นทางดังนี้

• ท่าอากาศยานนราธิวาส – ตัวเมืองนราธิวาส
• ท่าอากาศยานนราธิวาส – อำเภอตากใบ
• ท่าอากาศยานนราธิวาส – อำเภอสุไหงโก-ลก
• ท่าอากาศยานนราธิวาส – ด่านตาบา
• ท่าอากาศยานนราธิวาส – ปัตตานี
• ท่าอากาศยานนราธิวาส – ยะลา

• สถานีรถไฟตันหยงมัส (อ.ระแงะ) ตั้งอยู่ห่างจากท่าอากาศยานนราธิวาส ประมาณ 35 กิโลเมตร ผูโดยสารสามารถนั่งรถรีมูซีนจากท่าอากาศยานนราธิวาส ไปยังสถานีขนส่งนราธิวาส และต่อรถประจำทาง (สองแถว) สาย นราธิวาส - ตันหยงมัส เพื่อไปยังสถานีรถไฟได้[8]