จอกอวิชก่อตั้งมูลนิธิ "Novak Djokovic Foundation" ใน ค.ศ. 2007[102] เพื่อช่วยเหลือเด็กผู้ด้อยโอกาสทางการเงินและการศึกษา โดยมีการสร้างโรงเรียนกว่า 45 แห่งในประเทศเซอร์เบียรวมถึงมอบทุนการศึกษาสนับสนุนให้แก่เด็กๆในพื้นที่ชนบทหลายประเทศ โดยเฉพาะในทวีปแอฟริกาและอเมริกาใต้ และใน ค.ศ. 2015 จอกอวิชในฐานะประธานมูลนิธิ และ ทูตสันถวไมตรีคนใหม่ของ ยูนิเซฟ (UNICEF Global Goodwill Ambassadors) ได้เข้าพบนายจิม ยอง คิม ประธานธนาคารโลกเพื่อลงนามความร่วมมือในโครงการพัฒนาเด็กปฐมวัยของยูนิเซฟ (Early Childhood Development Program-ECD) ร่วมกับตัวแทนของยูนิเซฟและรัฐมนตรีว่าการกระทรวงการคลังของประเทศเซอร์เบียเพื่อร่วมหารือแนวทางช่วยเหลือเด็กๆในโครงการอย่างยั่งยืนต่อไป

ในปี 2019 บริษัทมงต์บลองค์ (Montblanc International) ผู้ผลิตสินค้าหรูหราของเยอรมนีได้ประกาศเปิดตัวปากการุ่นใหม่ "Montblanc X Djokovic Foundation" ออกจำหน่ายโดยมีเพียง 300 ด้ามในโลก ซึ่งรายได้ทั้งหมดจะมอบให้แก่มูลนิธิการ " Novak Djokovic Foundation" เพื่อช่วยเหลือเด็กผู้ด้อยโอกาสต่อไป โดยปากการุ่นดังกล่าวทำการเปิดตัวในนิวยอร์ก สหรัฐอเมริกาและมีการนำเอา StarWalker รูปแบบการเขียน Fineliner มาสลักลายเซ็นของ นอวาก จอกอวิช ซึ่งเป็นเจ้าของโครงการลงไปที่ตัวปากกาพร้อมสมุดจดและกล่องซึ่งมีลวดลายสวยงามแบบเดียวกับตัวปากกาโดยมีราคาขายอยู่ที่ชุดละ 740 ดอลลาร์สหรัฐ (ประมาณ 22,630 บาท)

ในการแข่งขันออสเตรเลียนโอเพนปี 2021 จอกอวิชได้บริจาคเงินจำนวน 1 ล้านดอลลาร์ให้กับบรรดาผู้เล่นที่ตกรอบในการแข่งขัน โดยเพจเฟซบุ๊กของจอกอวิชเปิดเผยว่า เขาตัดสินใจแบ่งเงินรางวัลดังกล่าวให้แก่นักเทนนิสที่ตกรอบแรกๆของรายการเพื่อช่วยเหลือเพื่อนร่วมอาชีพที่ขาดแคลนรายได้ในช่วงที่การแข่งขันต่างๆถูกยกเลิกจากวิกฤตโควิด-19 ทั่วโลก[103]

อนึ่ง นับตั้งแต่มีการแพร่ระบาดของโควิด-19 ในปี 2020 ส่งผลให้การแข่งขันรายการต่างๆทั่วโลกต้องถูกยกเลิก จอกอวิชได้ร่วมมือกับเฟเดอเรอร์ และ นาดัลในการระดมเงินเพื่อช่วยเหลือเพื่อนนักเทนนิสที่ได้รับผลกระทบ โดยเสนอให้มีการจัดตั้งกองทุนช่วยเหลือนักเทนนิสมืออันดับล่างๆของโลกที่กำลังประสบปัญหาทางการเงินอย่างหนัก จอกอวิชในฐานะอดีตประธานที่ปรึกษาสภานักเทนนิสของเอทีพี ทัวร์ ได้ส่งจดหมายถึงนักเทนนิสทุกคนเพื่อสอบถามเกี่ยวกับแผนการที่จะช่วยบรรเทาความเดือดร้อนของเพื่อนร่วมวงการในช่วงวิกฤตโควิด-19 โดยมีเป้าหมายอยู่ที่การระดมเงินให้ได้ราว 4 ล้านปอนด์เพื่อมอบให้แก่นักเทนนิสในอันดับที่ 250 ไปจนถึงอันดับที่ 700 ของโลกคนละ 8,000 ปอนด์[104]