โดยหลักแล้ว, ประธานาธิบดีที่ถูกเลือกจะมีวาระ 5 ปี ไม่มีโอกาสที่จะได้รับเลือกอีกสมัย อดีตประธานาธิบดีสามารถกลับมาอีกครั้งหลังจากพ้นจากตำแหน่งโดยครบวาระ [1] การเปลี่ยนรัฐบาลจะมีขึ้นในวันที่ 28 กรกฎาคม ซึ่งเป็นวันที่ประกาศเอกราชจากสเปนและเป็นวันหยุดราชการ

รัฐธรรมนูญแห่งเปรู ค.ศ. 1993 อันเป็นฉบับปัจจุบัน มาตรา 113 บัญญัติว่าตำแหน่งประธานาธิบดีจะสิ้นสุดเมื่อ

1. ประธานาธิบดีถึงแก่อสัญกรรม
2. ความทุพพลภาพทางกายหรือใจโดยถาวรของประธานาธิบดี ซึ่งประกาศโดยรัฐสภา
3. การยอมรับการลาออกของประธานาธิบดีโดยรัฐสภา
4. ออกจากประเทศโดยไม่ได้รับอนุญาตจากรัฐสภาหรือไม่กลับเข้ามาภายในระยะเวลาที่กำหนดไว้
5. ถูกไล่ออกหลังจากได้รับการลงโทษสำหรับการฝ่าฝืนใด ๆ ที่บัญญัติไว้ในมาตรา 117 แห่งรัฐธรรมนูญ

ประธานาธิบดี 4 คนที่ลาออกได้แก่ กิเยร์โม บิลิงกูรสต์ (ถูกบังคับให้ลาออก), อันเดรส อาเบลิโน กาเซเรส, อัลเบร์โต ฟูฆิโมริ และเปโดร ปาโบล กูชินส์กิ