นักกีฬาญี่ปุ่นผ่านมาตรฐานการเข้าร่วมมากขึ้นไม่ว่าจะโดยการคัดเลือกหรือการจัดอันดับโลก ในประเภทลู่และลาน (สามารถส่งนักกีฬาได้สูงสุด 3 คนต่อรายการ)[2][3] โดยจะได้รับคัดเลือกตามผลการแข่งขันเจแปนแชมเปียนชิป 2020 และเมื่อนักกีฬาได้รับเหรียญรางวัลจากการแข่งขันการเดินและการวิ่งมาราธอนหรือได้ 8 อันดับแรกจากการแข่งขันกรีฑาชิงแชมป์โลก 2019 ที่ โดฮา กาตาร์ ใน ปี 2019

นักวิ่งมาราธอน 4 คน (ชาย 2 หญิง 2) เป็นนักกีฬาชาวญี่ปุ่นกลุ่มแรกที่ได้เข้าร่วมแข่งขันครั้งนี้ เนื่องจากเป็นผู้ชนะ 2 ลำดับแรกในการแข่งขัน Grand Championship ที่ โตเกียว เมื่อวันที่ 15 กันยายน 2019 [4][5] และยังมี Toshikazu Yamanishi ที่คว้าเหรียญทองในการแข่งขันชิงแชมป์โลก และ Yusuke Suzuki นักกีฬาโอลิมปิกฤดูร้อน 2012 ที่ลอนดอน ได้ถูกเพิ่มชื่อเข้ามาอย่างเป็นทางการแล้ว.[6][7]