พระเจ้าราชวรวงศ์เธอ พระองค์เจ้าเณร มีพระโอรส 5 องค์ พระธิดา 1 องค์คือ[3]

• หม่อมเจ้าชายดิศ นีรสิงห์
• หม่อมเจ้าชายสิงห์ นีรสิงห์ (พ.ศ. 2382 - 21 เมษายน พ.ศ. 2432)
• หม่อมเจ้าชายแย้ม นีรสิงห์
• หม่อมเจ้าหญิงมรกฎ นีรสิงห์
• หม่อมเจ้าชายแฉ่ง นีรสิงห์ (ไม่มีข้อมูล - 30 มีนาคม พ.ศ. 2452)
• หม่อมเจ้าชายช้าง นีรสิงห์ (พ.ศ. 2409 - 7 ธันวาคม พ.ศ. 2444)