ฟูจิกาวางูจิโกะมีโรงเรียนที่สังกัดเทศบาลเมือง ได้แก่ โรงเรียนประถม 8 แห่ง โรงเรียนมัธยมต้น 2 แห่ง และโรงเรียนเอกชน ได้แก่ โรงเรียนประถม 1 แห่ง และโรงเรียนมัธยมต้น 1 แห่ง ฟูจิกาวางูจิโกะมีโรงเรียนมัธยมปลาย 1 แห่งที่สังกัดคณะกรรมการการศึกษาประจำจังหวัดยามานาชิ นอกจากนี้ ยังมีมหาวิทยาลัยวิทยาศาสตร์สุขภาพ (ญี่ปุ่น: 健康科学大学 โรมาจิ: Kenkō kagaku daigaku) ซึ่งเป็นโรงเรียนการแพทย์เอกชนที่ตั้งอยู่ในฟูจิกาวางูจิโกะ