มหาวิทยาลัยฮกไกโด (ญี่ปุ่น: 北海道大学 โรมาจิ: Hokkaidō daigaku, ฮกไกโดไดงะกุ; หรือเรียกสั้นๆในภาษาญี่ปุ่นว่า ฮกกุได) เป็นหนึ่งในมหาวิทยาลัยชั้นนำในประเทศญี่ปุ่นมหาวิทยาลัยก่อตั้งเมื่อ ค.ศ. 1876 ในชื่อ วิทยาลัยการเกษตรแห่งซับโปโร (Sapporo Agricultural College) ณ ซัปโปะโระ ต่อมาได้เปลี่ยนชื่อเป็น มหาวิทยาลัยจักรพรรดิฮกไกโด (北海道帝國大学; Hokkaido Teikoku Daigaku) เมื่อวันที่ 1 เมษายน ค.ศ. 1918 สมัยเมจิ ซึ่งเป็นหนึ่งเก้าในมหาวิทยาลัยจักรวรรดิของประเทศญี่ปุ่น