มหาวิทยาลัยเกอเทอแห่งแฟรงก์เฟิร์ต (อังกฤษ: Goethe University Frankfurt) หรือชื่อเต็มคือ มหาวิทยาลัยโยฮันน์ วอล์ฟกัง ฟอน เกอเทอ แห่งฟรังค์ฟวร์ทอัมไมน์ (เยอรมัน: Johann Wolfgang Goethe-Universität Frankfurt am Main) เป็นสถาบันอุดมศึกษาของรัฐ ตั้งอยู่ในนครแฟรงก์เฟิร์ต ประเทศเยอรมนี ก่อตั้งเมื่อปีค.ศ. 1914 เมื่อแรกก่อตั้งมีชื่อว่า มหาวิทยาลัยฟรังค์ฟวร์ทอัมไมน์ (เยอรมัน: Universität Frankfurt am Main) ก่อนที่ในปี 1932 ได้มีการนำเอาชื่อของ โยฮันน์ วอล์ฟกัง ฟอน เกอเทอ ผู้รู้รอบและนักปรัชญาชาวแฟรงก์เฟิร์ตมาเติมลงในชื่อมหาวิทยาลัยเพื่อเป็นเกียรติแก่เขา ปัจจุบันมีนักศึกษาในมหาวิทยาลัยแห่งนี้ราว 46,000 คนใน 16 คณะ มีบุคลากร 20 คนจากมหาวิทยาลัยแห่งนี้ที่ได้รับรางวัลโนเบล