มูลนิธิมอซิลลา เป็นโครงการที่ก่อตั้งขึ้นมาเพื่อพัฒนาซอฟต์แวร์ต่อจากเน็ตสเคป โดยได้ก่อตั้งขึ้นเมื่อปี 2546 และได้สร้างซอฟต์แวร์ ไฟร์ฟอกซ์ และ ธันเดอร์เบิร์ดบริษัทมอซิลลา เป็นโครงการที่พัฒนาต่อจากมูลนิธิมอซิลลา เพื่อจัดการหน่วยงานและดูแลไฟร์ฟอกซ์ต่อมอซิลลาเมสเซจจิง เป็นโครงการที่พัฒนาต่อคล้ายกับบริษัทมอซิลลา โดยเน้นดูแลและพัฒนาธันเดอร์เบิร์ด