มาร์มอตถูกจำแนกชนิดครั้งแรกโดย Thorington และ Hoffman[2] ชนิดล่าสุดที่พบคือ M. kastschenkoi[3] ปัจจุบันมาร์มอตถูกแยกเป็น 2 สกุลย่อย

• สกุล Marmota
  • สกุลย่อย Marmota
    • Alaska marmot, Brower's marmot, or Brooks Range marmot, M. broweri พบในรัฐอะแลสกา
    • Alpine marmot, M. marmota ถูกพบแค่ในเทือกเขาแอลป์, เทือกเขาแอเพนไนน์ในอิตาลี, เทือกเขาคาร์เพเทียน, เมือกเขาทาทรา, และเทือกเขาพิเรนีส
    • Black-capped marmot, M. camtschatica พบในไซบีเรียตะวันออก
    • Bobak marmot, M. bobak พบในยุโรปกลางและเอเชียกลาง
    • Forest-steppe marmot, M. kastschenkoi พบในรัสเซียใต้[3]
    • Gray marmot or Altai marmot, M. baibacina พบในไซบีเรีย
    • Groundhog, woodchuck, or whistlepig, M. monax พบมากที่สุดในอเมริกาเหนือ
    • Himalayan marmot or Tibetan snow pig, M. himalayana พบในเทือกเขาหิมาลัย
    • Long-tailed marmot, golden marmot, or red marmot, M. caudata พบในเอเชียกลาง
    • Menzbier's marmot, M. menzbieri พบในเอเชียกลาง
    • Tarbagan marmot, Mongolian marmot, or tarvaga, M. sibirica พบในไซบีเรีย
  • สกุลย่อย Petromarmota
    • Hoary marmot, M. caligata พบในตะวันตกเฉียงเหนือของทวีปอเมริกา (แคนาดาและอลาสก้า)
    • Olympic marmot, M. olympus พบแค่ใน Olympic Peninsula, รัฐวอชิงตัน, ประเทศสหรัฐอเมริกา
    • Vancouver Island marmot, M. vancouverensis พบแค่ในเกาะแวนคูเวอร์, บริติชโคลัมเบีย, ประเทศ
    • Yellow-bellied marmot, M. flaviventris พบในตะวันตกเฉียงใต้ของประเทศแคนาดา และตะวันตกของประเทศสหรัฐอเมริกา

ชนิดที่สูญพันธุ์ไปแล้ว โดยศึกษาได้จากฟอซซิล มีทั้งหมด 4 ชนิด

• †Marmota arizonae, ขุดพบในแอริโซนา, ประเทศสหรัฐอเมริกา[4]
• †Marmota minor, ขุดพบในเนวาดา, ประเทศสหรัฐอเมริกา[5]
• †Marmota robusta, ประเทศจีน
• †Marmota vetus, รัฐเนแบรสกา, ประเทศสหรัฐอเมริกา[6]