จนถึงปี 2012 ตัวแทนสาวงามจากฟิลิปปินส์ในการประกวดนางงามจักรวาลนั้นเป็นที่รู้จักกันในตำแหน่ง "บีนีบีนิงปีลีปีนัส - ยูนิเวิร์ส" จากเวทีการประกวดบีนีบีนิงปีลีปีนัส ในปี 2019 องค์การนางงามจักรวาลได้อนุญาตให้องค์กรมิสยูนิเวิร์สฟิลิปปินส์เป็นเอกเทศเพื่อสร้างความมั่นคงให้กับตำแหน่งมิสยูนิเวิร์สในประเทศ และร่วมมือกับบีนีบีนิงปีลีปีนัสในการคัดเลือกมิสยูนิเวิร์สฟิลิปปินส์ในปี 2019

การประกวดระดับชาติจะจัดเป็นครั้งแรกในปี 2020 เมื่อก่อนหน้านี้ที่จัดขึ้นโดยบีนีบีนิงปีลีปีนัส จะถูกส่งต่อให้กับ แชมซีย์ ซุปซุป-ลี อดีตมิสยูนิเวิร์สฟิลิปปินส์ 2011 และรองอันดับ 3 นางงามจักรวาล 2011 ซึ่งจะทำหน้าที่เป็นผู้อำนวยการประกวดของมิสยูนิเวิร์สฟิลิปปินส์ตั้งแต่ปี 2020 เป็นต้นไป[1] การประกวดจะเปิดตัวในปี 2020

ก่อนที่จะมีมิสยูนิเวิร์สฟิลิปปินส์ ตำแหน่งนี้จะผ่านการประกวดบีนีบีนิงปีลีปีนัส ในปี 1964 ถึง 2019[2]