องค์กรมิสแกรนด์ญี่ปุ่นได้รับการก่อตั้งขึ้นอย่างเป็นทางการในปี ค.ศ. 2016 โดย เอริโกะ โยชิอิ มิสแกรนด์ญี่ปุ่น 2013[1] โดยก่อนหน้า สตีเฟน ดิแอซ (Stephen I. Diáz) เป็นผู้ได้รับสิทธิ์ในการจัดหาตัวแทนหญิงสาวญี่ปุ่นเพื่อเข้าร่วมการประกวดมิสแกรนด์อินเตอร์เนชันแนล โดยได้มีการแต่งตั้งให้ เอริโกะ โยชิอิ และ มิเอโกะ ทาเคอูชิ เป็นผู้ดำรงตำแหน่งมิสแกรนด์ญี่ปุ่น 2013 และ มิสแกรนด์ญี่ปุ่น 2013 ตามลำดับ และเข้าร่วมการประกวดมิสแกรนด์อินเตอร์เนชันแนล ที่ประเทศไทย ในปีดังกล่าว ต่อมาในปี ค.ศ. 2015 ได้มีการจัดการประกวดมิสแกรนด์ญี่ปุ่นขึ้นเป็นครั้งแรกขึ้น โดยผู้ชนะการประกวดในครั้งนั้น คือ อายากะ ทานากะ (Ayaka Tanaka) ซึ่งได้เป็นตัวแทนประเทศญี่ปุ่นเข้าร่วมการประกวดมิสแกรนด์อินเตอร์เนชันแนล 2015 ในช่วงเดือนตุลาคมปีนั้นที่ประเทศไทย หลังจากเป็นต้นมา ได้มีการจัดประกวดมิสแกรนด์ญี่ปุ่นขึ้นเป็นประจำในช่วงเดือนกันยายนของทุกปี ภายใต้การดูแลควบคุมของ เอริโกะ โยชิอิ แห่งบริษัทแพร์ คอปอเรชั่น (Pair Coporation) ผู้ได้รับสิทธิ์การจัดประกวดมิสแกรนด์ญี่ปุ่นจากจากองค์กรมิสแกรนด์อินเตอร์เนชันแนล