รัฐบาลเฟลมิช (ดัตช์:  Vlaamse regering (วิธีใช้·ข้อมูล) ) เป็นฝ่ายบริหารของทั้งประชาคมเฟลมิชและแคว้นเฟลมิช (ฟลานเดอส์) ในประเทศเบลเยียม ประกอบด้วยคณะรัฐมนตรีซึ่งนำโดยมุขมนตรี (minister-president) และมีสภาเฟลมิชคอยกำกับดูแล การบริหารราชการแบ่งออกเป็น 13 ส่วนนโยบาย แต่ละส่วนมีแผนกบริหารและสำนักงานหลายสำนักงานคณะรัฐมนตรีเฟลมิชประกอบด้วยรัฐมนตรีจำนวนไม่เกิน 11 ตำแหน่งซึ่งได้รับการแต่งตั้งจากสภาเฟลมิช โดยต้องมีรัฐมนตรีอย่างน้อยหนึ่งคนมาจากบรัสเซลส์ ที่มาของรัฐมนตรีนั้นมาจากขั้วการเมืองต่าง ๆ ที่รวมกันเป็นพรรคร่วมรัฐบาล ผู้นำรัฐบาลโดยตำแหน่งคือมุขมนตรีฟลานเดอส์ โดยกลไกถ่วงดุลการทำงานของฝ่ายบริหารนั้นคล้ายกับรัฐบาลกลาง กล่าวคือ สภาเฟลมิชมีหน้าที่กำกับดูแล โดยรัฐมนตรีต้องนำเสนอนโยบายต่อสภา และต้องได้รับความไว้วางใจจากสภา