ในส่วนนี้จะจำแนกโรงเรียนในจังหวัดสมุทรสงครามตามอำเภอที่ตั้งของโรงเรียน โดยสีพื้นหลังของแต่ละแถวแสดงสังกัดของโรงเรียน

•   โรงเรียนสังกัดสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาสมุทรสงคราม (สำนักงานคณะกรรมการการศึกษาขั้นพื้นฐาน)
•   โรงเรียนสังกัดสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษามัธยมศึกษาเขต 10 (สำนักงานคณะกรรมการการศึกษาขั้นพื้นฐาน)
•   โรงเรียนสังกัดสำนักงานคณะกรรมการการศึกษาเอกชน
•   โรงเรียนสังกัดองค์กรปกครองส่วนท้องถิ่น

อำเภอเมืองสมุทรสงคราม

อำเภอเมืองสมุทรสงครามมี 44 โรงเรียน โดยแบ่งเป็นโรงเรียนสังกัดสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาสมุทรสงครามจำนวน 34 โรงเรียน สังกัดเทศบาลเมืองสมุทรสงคราม 5 โรงเรียน สังกัดสำนักงานคณะกรรมการการศึกษาเอกชน 5 โรงเรียน และสังกัดสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษามัธยมศึกษาเขต 10 จำนวน 3 โรงเรียน

อำเภอบางคนที

อำเภอบางคนทีมี 20 โรงเรียน โดยแบ่งเป็นโรงเรียนสังกัดสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาสมุทรสงครามจำนวน 1ุ6 โรงเรียน สังกัดสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษามัธยมศึกษาเขต 10 จำนวน 2 โรงเรียน สังกัดองค์การบริหารส่วนจังหวัดสมุทรสงคราม 1 โรงเรียน และสังกัดสำนักงานคณะกรรมการการศึกษาเอกชน 1 โรงเรียน

อำเภออัมพวา

อำเภออัมพวามี 35 โรงเรียน โดยแบ่งเป็นโรงเรียนสังกัดสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาสมุทรสงครามจำนวน 24 โรงเรียน สังกัดสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษามัธยมศึกษาเขต 10 จำนวน 4 โรงเรียน สังกัดสำนักงานคณะกรรมการการศึกษาเอกชน 4 โรงเรียน และสังกัดเทศบาลตำบลอัมพวา 3 โรงเรียน