ในส่วนนี้จะจำแนกโรงเรียนในจังหวัดอำนาจเจริญตามสังกัดของโรงเรียน ได้แก่

• สำนักงานคณะกรรมการการศึกษาขั้นพื้นฐาน (สพฐ.) ตามประกาศของกระทรวงศึกษาธิการ จังหวัดอำนาจเจริญอยู่ในพื้นที่ของเขตพื้นที่การศึกษามัธยมศึกษาเขต 29[1] และมีเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาจำนวน 1 เขต[2]
• องค์กรปกครองส่วนท้องถิ่น (อปท.)
• สำนักงานคณะกรรมการการศึกษาเอกชน (สช.)
  
• โรงเรียนสังกัดอื่น ๆ เช่น โรงเรียนตำรวจตระเวนชายแดน โรงเรียนพระปริยัติธรรม และโรงเรียนกีฬาในสังกัดมหาวิทยาลัยการกีฬาแห่งชาติ เป็นต้น

สำนักงานคณะกรรมการการศึกษาขั้นพื้นฐาน

สำนักงานเขตพื้นที่การศึกษามัธยมศึกษา เขต 29

จังหวัดอำนาจเจริญอยู่ในเขตพื้นที่การศึกษามัธยมศึกษา เขต 29 ร่วมกับจังหวัดอุบลราชธานี และมีโรงเรียนในสังกัดจำนวน 22 โรงเรียน โดยแบ่งเป็น 4 สหวิทยาเขตได้แก่

• สหวิทยาเขตเมืองอำนาจ รับผิดชอบโรงเรียนในอำเภอเมืองอำนาจเจริญ (4 โรงเรียน) และอำเภอเสนางคนิคม
• สหวิทยาเขตปทุมราชวงศา รับผิดชอบโรงเรียนในอำเภอเมืองอำนาจเจริญ (โรงเรียนสร้างนกทาวิทยาคม) อำเภอชานุมาน อำเภอปทุมราชวงศา
• สหวิทยาเขตหัวตะพาน รับผิดชอบโรงเรียนในอำเภอเมืองอำนาจเจริญ (3 โรงเรียน) และอำเภอหัวตะพาน
• สหวิทยาเขตพนา รับผิดชอบโรงเรียนในอำเภอเมืองอำนาจเจริญ (โรงเรียนปลาค้าววิทยานุสรณ์) อำเภอพนา และอำเภอลืออำนาจ

องค์กรปกครองส่วนท้องถิ่น

จังหวัดอำนาจเจริญมีโรงเรียนสังกัดองค์กรปกครองส่วนท้องถิ่น 8 โรงเรียน องค์กรปกครองส่วนท้องถิ่นที่มีโรงเรียนในความรับผิดชอบได้แก่เทศบาลเมืองอำนาจเจริญ (3 โรงเรียน) และเทศบาลตำบล 4 แห่ง