ในส่วนนี้จะจำแนกโรงเรียนในจังหวัดตามสังกัดของโรงเรียน ได้แก่

• สำนักงานคณะกรรมการการศึกษาขั้นพื้นฐาน (สพฐ.) ตามประกาศของกระทรวงศึกษาธิการ จังหวัดอยู่ในพื้นที่ของเขตพื้นที่การศึกษามัธยมศึกษาเขต [1] และมีเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาจำนวน เขต[2]
• องค์กรปกครองส่วนท้องถิ่น (อปท.)
• สำนักงานคณะกรรมการการศึกษาเอกชน (สช.)
  
• โรงเรียนสังกัดอื่น ๆ เช่น โรงเรียนตำรวจตระเวนชายแดน โรงเรียนพระปริยัติธรรม และโรงเรียนกีฬาในสังกัดมหาวิทยาลัยการกีฬาแห่งชาติ เป็นต้น

สำนักงานคณะกรรมการการศึกษาขั้นพื้นฐาน

เขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาของจังหวัดเลยแบ่งดังนี้[2]

• สำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาเลยเขต 1 ประกอบด้วยอำเภอเมืองเลย อำเภอนาด้วง อำเภอปากชม อำเภอเชียงคาน และอำเภอท่าลี่
• สำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาเลยเขต 2 ประกอบด้วยอำเภอวังสะพุง อำเภอผาขาว อำเภอภูกระดึง อำเภอเอราวัณ อำเภอหนองหิน และอำเภอภูหลวง
• สำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาเลยเขต 3 ประกอบด้วยอำเภอด่านซ้าย อำเภอภูเรือ และอำเภอนาแห้ว

สำนักงานเขตพื้นที่การศึกษามัธยมศึกษา เขต 19

จังหวัดเลยอยู่ในเขตพื้นที่การศึกษามัธยมศึกษาเขต 19 ร่วมกับจังหวัดหนองบัวลำภู[1] และมีโรงเรียนในสังกัดจำนวน 30 โรงเรียน โดยแบ่งเป็น 3 สหวิทยาเขต[3]ได้แก่

• สหวิทยาเขตหลักเมืองเลย รับผิดชอบโรงเรียนในอำเภอเมืองเลย อำเภอนาด้วง อำเภอเชียงคาน อำเภอปากชม และอำเภอท่าลี่
• สหวิทยาเขตวังภูผา รับผิดชอบโรงเรียนในอำเภอวังสะพุง อำเภอภูกระดึง อำเภอภูหลวง อำเภอผาขาว อำเภอเอราวัณ และอำเภอหนองหิน
• สหวิทยาเขตศรีสองรัก รับผิดชอบโรงเรียนในอำเภอด่านซ้าย อำเภอภูเรือ และอำเภอนาแห้ว

สำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาเลยเขต 1

สพป.เลย เขต 1 มีพื้นที่ครอบคลุม 5 อำเภอทางตอนเหนือของจังหวัด ได้แก่อำเภอเมืองเลย อำเภอนาด้วง อำเภอปากชม อำเภอเชียงคาน และอำเภอท่าลี่

สำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาเลยเขต 2

สพป.เลย เขต 2 มีพื้นที่ครอบคลุม 6 อำเภอทางตอนกลางและตอนใต้ของจังหวัด ได้แก่อำเภอวังสะพุง อำเภอภูกระดึง อำเภอภูหลวง อำเภอผาขาว อำเภอเอราวัณ และอำเภอหนองหิน

สำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาเลยเขต 3

สพป.เลยเขต3มีพื้นที่ครอบคลุม 3 อำเภอทางตะวันตกของจังหวัด ได้แก่อำเภอด่านซ้าย อำเภอภูเรือ และอำเภอนาแห้ว

องค์กรปกครองส่วนท้องถิ่น

จังหวัดเลยมีโรงเรียนสังกัดองค์กรปกครองส่วนท้องถิ่น 26 โรงเรียน องค์กรปกครองส่วนท้องถิ่นที่มีโรงเรียนในความรับผิดชอบได้แก่องค์การบริหารส่วนจังหวัดเลย (3 โรงเรียน) เทศบาลเมืองเลย (5 โรงเรียน) เทศบาลเมืองวังสะพุง (3 โรงเรียน) เทศบาลตำบล 10 แห่งและองค์การบริหารส่วนตำบล 3 แห่ง

สำนักงานคณะกรรมการการศึกษาเอกชน

• โรงเรียนอนุบาลธีรญาฟ้าใส
• โรงเรียนมหาไถ่ศึกษาเลย
• โรงเรียนหทัยคริสเตียน
• โรงเรียนหฤทัยคริสเตียน
• โรงเรียนวรราชวิทยา
• โรงเรียนอนุบาลมณีรัตน์
• โรงเรียนประจันตวิทยา
• โรงเรียนอนุบาลประจันตะ
• โรงเรียนอนุบาลภูกระดึง

โรงเรียนสาธิต

• โรงเรียนสาธิตมหาวิทยาลัยราชภัฏเลย (แผนกมัธยมศึกษา)