ตัวละครหลัก

อิเลกูลาร์ฮันเตอร์

เอ็กซ์ (エックス, X)พากย์เสียงโดย โมริคุโบ โชทาโร (森久保 祥太郎)ซีโร่ (ゼロ, Zero)พากย์เสียงโดย โอกิอะยุ เรียวทาโร (置鮎 龍太郎)เอเลีย (エイリア, Alia)ซิกนาส (シグナス, Signas)หัวหน้าคนใหม่ของหน่วยเรปพิฟอร์ซเป็นหุ่นยนต์ตัวสุดท้ายของดร.เคนก่อนที่จะเสียชีวิตไป ทำหน้าที่มอบคำสั่งให้กับเอ็กซ์และซีโร่ไลฟ์เซฟเวอร์ (ライフセーバー, Lifesavor)ดั๊กลาส (ダグラス, Doglas)นักประดิษฐ์ของหน่วยเรปพิฟอร์ซ

กลุ่มศัตรูม่านมืด

ไดนาโม (ダイナモ)พากย์เสียงโดย โมริคุโบ โชทาโร (森久保 祥太郎)ซิกม่า (シグマ, Sigma)ดร.ไวลี่ (Dr.ワイリー)นักวิทยาศาตร์ผู้ชั่วร้ายในอดีตเป็นผู้ที่สร้างซีโร่ขึ้นมา

ตัวละครบอส

บอสหลัก

ในเวอร์ชันภาษาอังกฤษได้มีชื่อที่ 2 ซิ่งมาจากในเวอร์ชันอังกฤษมาจากหนังสือ Mega Man X Official Complete Works และ MM25 Mega Man & Mega Man X Official Complete Works นอกจากนี้ลงในเกม ร็อคแมน X Anniversary Collection 2 โดยชื่อถูกปรับเปลี่ยนให้เหมือนของต้นฉบับในญี่ปุ่น

เครเซนต์ กริซลี่ (クレッセント・グリズリー)ชื่อภาษาอังกฤษเดิมคือ กริชลี่ สแลช (Grizzly Slash) ส่วนชื่อที่ 2 เป็นชื่อเดียวกับภาษาญี่ปุ่นโวลท์ คราเคน (ボルト・クラーケン)ชื่อภาษาอังกฤษเดิมคือ สควิด แอดเลอร์ (Squid Adler) ส่วนชื่อที่ 2 เป็นชื่อเดียวกับภาษาญี่ปุ่นไชนิ่ง โททัลนิคัส (シャイニング・ホタルニクス)ชื่อภาษาอังกฤษเดิมคือ อิซซี่ โกลว์ (Izzy Glow) ชื่อที่ 2 คือ ไชนิ่ง ไฟร์ฟลาย (Shining Firefly)ไทดัล มาโคเอน (タイダル・マッコイーン)ชื่อภาษาอังกฤษเดิมคือ ดัฟ แมคเวลเลน (Duff McWhalen) ส่วนชื่อที่ 2 คือ ไทดัล เวลล์ (Tidal Whale)สไปรัล เพกาเชียน (スパイラル・ペガシオン)ชื่อภาษาอังกฤษเดิมคือ เดอะ สกายเวอร์ (The Skiver) ส่วนชื่อที่ 2 คือ สไปรัล เปกาซัส (Spiral Pegasus)สไปค์ โรสเรด (スパイク・ローズレッド)ชื่อภาษาอังกฤษเดิมคือ เอ็กเซลเดอะเรด (Axle the Red) ส่วนชื่อที่ 2 เป็นชื่อเดียวกับภาษาญี่ปุ่นดาร์ค เนโครแบท (ダーク・ネクロバット)ชื่อภาษาอังกฤษเดิมคือ ดาร์ค ดิชชี่ (Dark Dizzy) ส่วนชื่อที่ 2 เป็นชื่อเดียวกับภาษาญี่ปุ่นเบิร์น ไดโนเร็กซ์ (バーン・ディノレックス)ชื่อภาษาอังกฤษเดิมคือ แมทเร็กซ์ (Mattrex) ส่วนชื่อที่ 2 เป็นชื่อเดียวกับภาษาญี่ปุ่น

บอสตัวอื่นๆ

ซิกม่าเฮด (シグマヘッド)ปรากฏตัวในฉากแรกของเอ็กซ์และซีโร่ชาโดว์เดวิล (シャドーデビル)แรงดา แบงดา W (ランダ・バンダW)ซีโร่ (ゼロ, Zero)เอ็กซ์ อัลติเมทอาร์เมอร์ (エックスアルティメットアーマー)บอสตัวที่ 3 ของซีโร่โดยเอ็กซ์ใช้เกราะอัลติเมทอาร์เมอร์โดยมีสีแบบ X4 รวมถึงใช้อาวุธ Soul Body, Frost Tower และ Double Cyclone ได้ไฟนอลซิกม่า W (ファイナルシグマW)