ตัวละครหลัก ของ ร็อคแมน_X6

  • เอ็กซ์ (エックス, X) พากย์เสียงโดย โมริคุโบ โชทาโร (森久保 祥太郎)
อิเรกูลาร์ฮันเตอร์ระดับ B ที่มีความสามารถใช้บัสเตอร์ได้อย่างแม่นยำ เมื่อ 3 ปีก่อนได้มีสงครามไวรัส X ได้ซีโร่ช่วยชีวิตอีกครั้งจนรอดตายและได้ดาบของซีโร่มาชื่อ "Z-Saber" ซึ่งนั้นเป็นความสามารถเหนือบัสเตอร์อีก 2 เท่าหัวหน้าของเอ็กซ์นักประดิษฐ์ของหน่วยเรปพิฟอร์ซนักวิทยาศาสตร์เป็นอดีตเพื่อนร่วมงานกับ เอเลีย แต่หลังแยกตัวกับเอเลียอีก 3 เดือนต่อมา เกทได้พบ ไนท์แมร์ DNA และได้ทำการทดลองจนได้มีความทะเยอทะยานที่จะทำลายโลก
  • ไอซ็อค (アイゾック, Isoc) พากย์เสียงโดย ทาเคชิ อาโอโนะ (青野武)
นักวิทยาศาตร์ที่ทำงานรวมกับ เกท
  • ไฮแม็กซ์ (ハイマックス, High Max) พากย์เสียงโดย โนริโอะ วาคาโมโตะ (若本 規夫)
หุ่นยนต์ลูกน้องของไอซ็อคทำหน้าที่ตามหน้าไนท์แมร์ไวรัส
  • ไดนาโม (ダイナモ) พากย์เสียงโดย โมริคุโบ โชทาโร (森久保 祥太郎)
  • ซิกม่า (シグマ, Sigma) พากย์เสียงโดย มุจิฮิโตะ (麦人)
อดีตอีเรกูลาร์ฮันเตอร์มีความทะเยอทะยานที่จะทำลายล้างโลกและมนุษยชาติ หลังจาก 3 เดือนจากการสเปชโคโลนี่ยูราเซียตกลงมายังโลกซิกม่าร่างกายไม่สมบรูณ์แต่เกทได้ค้นพบและเริ่มประกอบแต่ไม่สมบูรณ์จึงฆ่าเกทเป็นการตอบแทน