หลังกัมพูชาได้รับเอกราชจากฝรั่งเศสเมื่อ ค.ศ. 1953 มีการตั้งพระราชอาณาจักรกัมพูชาขึ้นใหม่ โดยมีเจ้าชายสีหนุ ผู้นำพรรคสังคมราษฎรนิยม ทรงปกครองประเทศ เจ้าชายสีหนุมีพระดำริจะสร้างสิ่งที่ระลึกและเฉลิมฉลองการได้รับเอกราช โดยเป็นสถาปัตยกรรมที่ผสมผสานรูปแบบเขมรโบราณกับสมัยใหม่ วัณณ์ โมลีวัณณ์ จึงได้รับหน้าที่ออกแบบเป็นวิมานเอกราชแห่งนี้ โดยสร้างเป็นสถูปรูปทรงคล้ายดอกบัว ซึ่งรับแนวคิดมาจากสถูปที่ปราสาทบันทายศรี

ช่วงเฉลิมฉลองระดับชาติ วิมานเอกราชจะเป็นศูนย์กลางของกิจกรรม และสมาชิกราชวงศ์หรือข้าราชการชั้นสูงจะมาจุดเพลิงพิธีบนฐานภายในวิมาน ทั้งมีการวางดอกไม้สักการะตามบันไดวิมาน นอกจากนี้ ในแต่ละปี มักมีชาวต่างชาติและชาวท้องถิ่นมาเยือนวิมานเอกราช ด้านหลังวิมานยังมีรูปจำลองพระบรมรัตนโกศที่สร้างขึ้นใน ค.ศ. 2013