สงครามโคลนถูกกล่าวถึงครั้งแรกในภาพยนตร์สตาร์ วอร์ส เอพพิโซด 4: ความหวังใหม่ โดยโอบีวัน เคโนบีและเจ้าหญิงเลอา ออร์กานา แม้จะยังไม่มีการอธิบายในตอนนั้นว่าสงครามโคลนคืออะไร วลีจำพวก "ในช่วงสงครามโคลน..." มักถูกใช้ในผลงานเรื่องแต่งต่างๆ เพื่อเพิ่มความลึกของการบรรยาย แนวคิดแรกๆ ของสงครามโคลนคือสงครามระหว่างสาธารณรัฐกับชาวแมนดาลอเรียนเช่นที่มีการอ้างถึงใน Tha Galactic Empire Scrapbook ซึ่งมีขึ้นนานหลายปีก่อนที่แนวคิดจริงๆ ของสงครามโคลนจะถูกคิดขึ้น ในช่วงนั้นมักเป็นที่ถือกันว่าสงครามโคลนจบสิ้นลงเป็นเวลานานก่อนการก่อตั้งจักรวรรดิกาแลกติก หนังสือ A Guide to the Star Wars Universe ระบุว่าสงครามโคลนจบสิ้นลงในปีที่ 35 ก่อนยุทธการยาวิน (ซึ่งถูกแก้ไขใหม่ในภายหลังว่าเป็นการจัดระเบียบใหม่ครั้งใหญ่) และมอน มอธมาใน The Farlander Papers ได้พูดถึง 'หลายทศวรรษแห่งความสงบสุข' (decades of peace) ระหว่างการสิ้นสุดของสงครามโคลนกับการก่อตั้งจักรวรรดิ ในขณะที่พัลพาทีนได้รับการเลือกตั้งให้เป็นประธานาธิบดีในช่วงสงครามแต่ยังไม่ถือตนเองเป็นจักรพรรดิและกวาดล้างเหล่าเจไดจนกระทั่งเป็นเวลานานหลังจากนั้น อย่างไรก็ดีในหนังสือการ์ตูนชุด Star Wars ของสำนักพิมพ์ Marvel ได้กล่าวถึงสงครามโคลนไว้ว่าเป็นเหตุการณ์ที่เกิดขึ้นในช่วงหลังมากพอทีเลอา ออร์กานา จะเป็นบุคคลสำคัญคนหนึ่ง และพัลพาทีนก็ได้ขึ้นครองอำนาจแล้ว ในช่วงที่หนังสือนิยายเรื่องแต่งเสริมยังเป็นลิขสิทธิ์ของสำนักพิมพ์ Bantam นั้น ผู้แต่งมักประสบปัญหาข้อจำกัดในการบรรยายถึงเหตุการณ์ในสงครามโคลน นอกจากนั้น ก่อนที่ภาพยนตร์สตาร์ วอร์ส เอพพิโซด 2: กองทัพโคลนส์จู่โจมจะเข้าฉาย คนส่วนใหญ่เชื่อว่า "โคลน" ใน "สงครามโคลน" หมายถึงว่าพวกโคลนเป็นตัวร้ายในสงครามกับสาธารณรัฐและเจได และผลงานในเรื่องแต่งเสริมที่ถูกเขียนขึ้นก่อนปีพ.ศ. 2545 ก็สนับสนุนแนวความคิดนี้

แนวความคิดดังกล่าวนั้นเปลี่ยนไปในปีพ.ศ. 2545 เพื่อภาพยนตร์สตาร์ วอร์ส เอพพิโซด 2: กองทัพโคลนส์จู่โจมเข้าฉาย ในช่วงสามปีระหว่างปีพ.ศ. 2545 ที่กองทัพโคลนส์จู่โจมเข้าฉายกับปีพ.ศ. 2548 ที่ซิธชำระแค้นเข้าฉายนั้น มีการนำการตลาดแบบหลายสื่อเข้ามาใช้ (เหมือนอย่างที่เคยใช้กับ Shadow of the Empire ในปีพ.ศ. 2539) ได้แก่หนังสือ หนังสือการ์ตูน วิดีโอเกม แม้กระทั่งข่าวชุด HoloNet News ในนิตยสาร Star Wars Insider ซึ่งจะกล่าวถึงเหตุการณ์ที่เกิดขึ้นในช่วงเวลานั้น

หลังจากภาพยนตร์กองทัพโคลนส์จู่โจมและซิธชำระแค้นออกฉาย ผลงานเรื่องแต่งเสริมในเหตุการณ์ช่วงภาพยนตร์ไตรภาคเดิมและต่อจากนั้นได้พยายามที่จะสอดแทรกข้อมูลใหม่เหล่านี้ลงไป ตัวอย่างที่เห็นได้ชัดเช่นในหนังสือการ์ตูนชุด Star Wars: Empire (ซึ่งจะพบว่ามียานรบรุ่น Acclamator-class และ AT-TE อยู่ด้วย) การเปิดเผยโฉมหน้าของโบบา เฟตต์ในหนังสือการ์ตูนหลายเล่ม และอาร์ทูดีทูระลึกถึงเหตุการณ์จากซิธชำระแค้น (เช่นปฏิบัติการ: กวาดล้างอัศวินและการเกิดของลุคและเลอาบนโปลิส แมสซา) ในหนังสือนิยายไตรภาคชุด Dark Nest

ความคล้ายคลึงกับประวัติศาสตร์จริง