ท้องที่อำเภอป่าบอนเดิมเป็นส่วนหนึ่งของอำเภอปากพะยูน ทางราชการได้แบ่งพื้นที่การปกครองตำบลป่าบอน ตำบลหนองธง และตำบลโคกทราย ของอำเภอปากพะยูน ออกมาตั้งเป็น กิ่งอำเภอป่าบอน ตามประกาศกระทรวงมหาดไทยลงวันที่ 7 เมษายน พ.ศ. 2526 โดยมีผลบังคับตั้งแต่วันที่ 26 เมษายน ปีเดียวกัน[1]

และต่อมาได้มีพระราชกฤษฎีกายกฐานะกิ่งอำเภอป่าบอน อำเภอปากพะยูน ขึ้นเป็น อำเภอป่าบอน[2] ตามประกาศกระทรวงมหาดไทยลงวันที่ 10 พฤษภาคม พ.ศ. 2533 โดยให้มีผลตั้งแต่วันที่ 21 พฤษภาคม ปีเดียวกัน