อินกิกาโย เปิดตัวในชื่อ SBS Popular Song ในปี 1991 เป็นรายการจัดอันดับเพลง, แต่ถูกยุติการออกอากาศในฤดูใบไม้ผลิปี 1993. และออกอากาศอีกครั้งในปี 1998 ด้วยชื่อเดิม และรูปแบบรายการเดิม. ในปี 2003, รายการได้นำการจัดอันดับชาร์ตออก และแทนที่ด้วยระบบ Take 7, ที่จะนำ 7 ศิลปินที่ได้ความนิยม และโดดเด่นที่สุดในแต่ละสัปดาห์ มาหาศิลปินที่ได้รับความนิยมสูงสุดจากทั้งหมด. เพื่อรับรางวัล Mutizen Song.

ในฤดูใบไม้ผลิปี 2007, รายการเปลี่ยนรูปแบบการออกอากาศจากการบันทึกเทป เป็นการถ่ายทอดสดเพื่อเพิ่มเรตติ้งของรายการ, และเปลี่ยนชื่อรายการเป็น Inkigayo. วันที่ 2 พฤศจิกายน 2008, รายการเปลี่ยนเวลาออกอากาศจาก 3:20 pm เป็น 4:10 pm ในบ่ายของวันอาทิตย์, ไปออกอากาศก่อนรายการ Good Sunday, เพื่อเพิ่มเรตติ้งให้กับรายการ. ในฤดูใบไม้ผลิปี 2010, รายการเพิ่มเวลาออกอากาศเป็น 70 นาที เริ่มตั้งแต่เวลา 3:50 pm ของทุกๆ วันอาทิตย์.

วันที่ 10 กรกฎาคม 2012, SBS ประกาศเปลี่ยนแปลงรูปแบบรายการโดยนำระบบ Take 7 และรางวัล Mutizen Song ออก, โดยได้อธิบายว่า "พวกเราชื่อว่า, สิ่งที่สำคัญที่สุดก็คือแนวเพลง K-Pop ได้รับความนิยมแพร่หลายไปทั่วโลก. ก่อนหน้านี้, เราได้ตัดสินใจที่จะยกเลิกระบบนี้ในการประชุม. จริงๆ แล้วไม่มีอะไรอยู่เบื้องหลังการจัดอันดับนี้เลย. พวกเราได้ตัดสินใจใช้การเปลี่ยนแปลงนี้ และหวังว่าผู้ชมจะได้ความบันเทิงมากขึ้นจากเสียงเพลง. มีศิลปินในวงการเพลง จำนวนมากที่มีพรสวรรค์. เราต้องการที่จะฉีกกรอบจากระบบเดิมๆ, เพื่อให้ศิลปินได้ออกเพลงใหม่ และแสดงอย่างเต็มที่, ดังนั้นเราจึงมีแผนที่จะออกแบบระบบใหม่ โดยมีแนวคิดที่จะเพิ่มเวทีพิเศษ เพื่อให้ผู้ชมได้รับความบันเทิงมากขึ้น, เราจะมีเวทีพิเศษต่างๆ และอีกมากมาย." การนำระบบ Take 7 และรางวัล Mutizen Song ออกไป เริ่มตั้งแต่วันที่ 15 กรกฎาคม 2012.[2]

ในวันที่ 3 มีนาคม 2013, รายการประกาศกลับมาใช้ระบบการจัดอันดับแบบชาร์ตอีกครั้งโดยเรียกว่า "อินกีกาโย ชาร์ต". โดยชาร์ตใหม่จะมีการร่วมมือกับ สมาคมอุตสาหกรรมเพลงของเกาหลี (Music Industry Association of Korea) Gaon Chart, เริ่มตั้งแต่ 17 มีนาคม 2013.[3]