พื้นที่โดยทั่วไปของเทศบาลตำบลดอนเกาะกา มีพื้นที่เป็นที่ราบต่อเนื่องจากตำบลสิงโตทอง ตำบลดอนฉิมพลี และตำบลโยธะกา โครงสร้างภายในประกอบด้วยคลองหลายสาย เช่น คลอง 20 คลอง 21 คลองหกวา บึงไผ่ บึงขุนรักษ์ และบึงตาหอม เป็นต้น คลองเหล่านี้เป็นแหล่งน้ำเพื่อการเกษตร การระบายน้ำ และช่วยในการขนส่งผลผลิตด้วย

• ทิศเหนือ ติดต่อกับ ตำบลพระอาจารย์ และตำบลบางสมบูรณ์ อำเภอองครักษ์ จังหวัดนครนายก
• ทิศใต้ ติดต่อกับ ตำบลสิงโตทอง อำเภอบางน้ำเปรี้ยว จังหวัดฉะเชิงเทรา
• ทิศตะวันตก ติดต่อกับ ตำบลดอนฉิมพลี อำเภอบางน้ำเปรี้ยว จังหวัดฉะเชิงเทรา
• ทิศตะวันออก ติดต่อกับ ตำบลโยธะกา อำเภอบางน้ำเปรี้ยว จังหวัดฉะเชิงเทรา