ในเขตเทศบาลเมืองบ้านพรุมีสถานศึกษาตั้งแต่ระดับก่อนวัยเรียน ระดับประถมศึกษา ระดับมัธยมศึกษา มีทั้งโรงเรียนในสังกัดรัฐบาลและเอกชน โดยมีสถานศึกษาที่อยู่ในเขตเทศบาลเมืองบ้านพรุ ดังนี้

• ศูนย์การเรียนรู้ชุมชนมหาวิทยาลัยรามคำแหง (ปริญญาตรี)
• โรงเรียนหาดใหญ่วิทยาลัย 2 (มัธยมศึกษา)
• โรงเรียนบ้านโปะหมอ (อนุบาล-ประถมศึกษา)
• โรงเรียนวัดเทพชุมนุม (อนุบาล-ประถมศึกษา)
• โรงเรียนกิตติวิทย์บ้านพรุ (เอกชน; อนุบาล-ประถมศึกษา-มัธยมศึกษา)
• ศูนย์พัฒนาเด็กเล็กเทศบาลเมืองบ้านพรุ