เนื้อเรื่องเกิดขึ้นหนึ่งศตวรรษหลังจากเหตุการณ์ของเรย์แมน ออริจินส์ ซึ่งเรย์แมน, โกลบอกซ์ และทีนซีนอนหลับมานานนับศตวรรษ ในช่วงเวลานั้น ฝันร้ายของบับเบิลดรีมเมอร์ได้เพิ่มขึ้นในด้านความแข็งแกร่งและจำนวน รวมถึงมีเหล่านักเวทย์ (ผู้รอดชีวิตจากการระเบิดในเรย์แมน ออริจินส์) ที่แยกออกเป็น "ดาร์กทีนซี" 5 ตัว เรย์แมนและเพื่อน ๆ ได้รับการปลุกให้ตื่นขึ้นโดยเมอร์ฟีเพื่อนของพวกเขาที่บอกพวกเขาเกี่ยวกับข่าวร้าย และบอกพวกเขาว่าเจ้าหญิงทั้ง 10 แห่งดินแดน (รวมถึงบาร์บารา) และเหล่าทีนซีถูกจับขังโดยฝันร้ายและดาร์กทีนซี เรย์แมน, โกลบอกซ์, ทีนซี และเมอร์ฟีจึงออกเดินทางเพื่อกำจัดภัยคุกคามใหม่ ๆ เหล่านี้ หลังจากเอาชนะดาร์กทีนซี 4 ตัว และต่อสู้กับฝันร้ายที่เลวร้ายที่สุด เรย์แมนและผองเพื่อนก็ไปที่โอลิมปัสแมกซิมัสและเผชิญหน้ากับเมฆยักษ์แห่งฝันร้ายอันบริสุทธิ์ หลังจากความมืดถูกทำลายและดาร์กทีนซีตัวสุดท้ายถูกส่งไปยังดวงจันทร์ ก็มีการแสดงชื่อเครดิต หากทีนซีสี่ร้อยตัวได้รับการช่วยเหลือผู้เล่นจะปลดล็อกโลกสุดท้ายของเกม นั่นคือลีฟวิงเดดปาร์ตี เมื่อเสร็จสิ้น ฝันร้ายจะถูกกำจัดและผู้เล่นจะได้รับรางวัล 10,000 ลัม รวมถึง 6 ภาพวาดการบุกรุกใหม่ เมื่อผู้เล่นช่วยเหลือทีนซีทั้ง 700 ชีวิต (หรือ 826 ชีวิตสำหรับเวอร์ชันนินเท็นโดสวิตช์) พวกเขาจะปลดล็อกทีนซีสีทอง[15]