เอกกมล คีรีวัฒน์ เคยทำงานเป็นเลขาธิการคณะกรรมการกำกับหลักทรัพย์และตลาดหลักทรัพย์ ในระหว่างปี 2535 - 2538 เป็นเลขาธิการคนแรกของ ก.ล.ต.[2] เป็นประธานบริษัทเอกชนหลายแห่ง อาทิ บริษัท เค.ซี. พร็อพเพอร์ตี้ จำกัด (มหาชน) บริษัท หลักทรัพย์ ซีมิโก้ จำกัด (มหาชน)

เขาเป็นกรรมการธนาคารแห่งประเทศไทย ในระหว่างปี 2540 - 2543 หลังจากนั้นได้ลงสมัครรับเลือกตั้งสมาชิกสภาผู้แทนราษฎรแบบบัญชีรายชื่อ ในสังกัดพรรคประชาธิปัตย์ ลำดับที่ 11 และได้รับเลือกตั้ง[3] เป็น ส.ส.สมัยแรก