เอนดน มะห์มูด เกิดเมื่อวันที่ 24 ธันวาคม ค.ศ. 1940 ที่เมืองกลัง รัฐเซอลาโงร์ โดยเป็นบุตรีของดาโต๊ะ มะห์มุด อัมบะก์ ชาวมลายู กับดาติน มาเรียม อับดุลละห์ ชาวญี่ปุ่น เธอมีพี่น้อง 10 คน โดยรวมไปถึงน้องสาวฝาแฝดชื่อ โนไรนี และมีน้องสาวคนอื่นเช่น นนนี, ระห์มะห์ และอะอีซะห์

บิดาของเธอทำงานในเหมืองแร่ และต่อมาได้ย้ายทำในรัฐเปรักเพื่อดูแลเหมือง 60 แห่งในเขตเมืองกัมปาร์ เอนดนจึงใช้ชีวิตในวัยเด็กของเธอในเมืองกัมปาร์ และได้รับการศึกษาครั้งแรกที่โรงเรียนอังกฤษ-จีน (Anglo-Chinese School) ซึ่งปัจจุบันคือโรงเรียนประถมนานาชาติเมโธดิสต์ (Methodist National Type Primary School) ต่อมาเธอได้ศึกษาต่อที่โรงเรียนมัธยมเซนต์แมรี (St Mary’s secondary school) ในกัวลาลัมเปอร์

เอนดนพบกับอับดุลละห์ เมื่อ ค.ศ. 1960 ในขณะที่เธอทำงานในสำนักงาน Federal Establishment Office ซึ่งปัจจุบันคือหน่วยบริการมหาชน (Public Service Department) และทั้งคู่ได้แต่งงานกันในปี ค.ศ. 1965 ซึ่งต่อมาเอนดนจึงลาออกจากงานใน ปี ค.ศ. 1976

อับดุลละห์ และเอนดนมีบุตรธิดาด้วยกันสองคน โดยบุตรคนแรกเป็นชาย คือ ดาโต๊ะกามาลุดดิน อับดุลละห์ ปัจจุบันได้สมรสแล้วกับอัซรีน อับดุลละห์ ส่วนบุตรสาวชื่อ โนรี อับดุลละห์ ปัจจุบันได้สมรสแล้วกับไครี จามาลุดดิน โดยมีหลานให้แก่อับดุลละห์และเอนดนรวมกัน 4 คน