เอมอร สินธุไพร เกิดเมื่อวันที่ 26 สิงหาคม พ.ศ. 2502 ที่อำเภอพนมไพร จังหวัดร้อยเอ็ด เป็นบุตรนายจำนงค์ อนุสงค์ และ นางหม่อม เนตรรักษ์ มีพี่น้อง 3 คน สำเร็จการศึกษาครุศาสตรบัณฑิต สาขาบริหารการศึกษา มหาวิทยาลัยราชภัฏบุรีรัมย์ และปริญญาโท รัฐศาสตร์มหาบัณทิต มหาวิทยาลัยรามคำแหง สมรสกับนายนิสิต สินธุไพร อดีต ส.ส.ร้อยเอ็ดหลายสมัย และเป็นอดีตแกนนำกลุ่มแนวร่วมประชาธิปไตยต่อต้านเผด็จการแห่งชาติ มีบุตร 2 คน คือ นางสาวจิราพร สินธุไพร และนางสาวชญาภา สินธุไพร