เอเนออสเริ่มเข้ามาก่อตั้งและดำเนินธุรกิจในประเทศไทยในปี พ.ศ. 2538 ภายใต้ชื่อบริษัท เอ็มโอซี ไทย จำกัด ด้วยทุนจดทะเบียน 310 ล้านบาท ตั้งแต่นั้นมา ชื่อบริษัทได้มีการเปลี่ยนแปลงดังนี้

• บริษัท นิปปอน ออยล์ (ประเทศไทย) จำกัด ในปี 2546
• บริษัท เจเอ็กซ์ นิปปอน ออยล์ (ประเทศไทย) จำกัด ในปี 2554
• บริษัท เอเนออส (ประเทศไทย) จำกัด ในปี 2563