แขวงบางบอนมีอาณาเขตติดต่อกับเขตการปกครองข้างเคียงดังนี้

• ทิศเหนือ ติตต่อกับแขวงหนองแขม (เขตหนองแขม) แขวงหลักสอง แขวงบางแค (เขตบางแค) แขวงบางหว้า (เขตภาษีเจริญ) มีคลองหนามแดงและคลองบางโคลัดเป็นเส้นแบ่งเขต
• ทิศตะวันออก ติดต่อกับแขวงบางขุนเทียน (เขตจอมทอง) มีคลองวัดสิงห์เป็นเส้นแบ่งเขต
• ทิศใต้ ติดต่อกับแขวงแสมดำ (เขตบางขุนเทียน) มีทางรถไฟสายแม่กลองช่วงวงเวียนใหญ่–มหาชัยเป็นเส้นแบ่งเขต
• ทิศตะวันตก ติดต่อกับตำบลบางน้ำจืด อำเภอเมืองสมุทรสาคร ตำบลแคราย อำเภอกระทุ่มแบน (จังหวัดสมุทรสาคร) มีแนวแบ่งเขตการปกครองระหว่างกรุงเทพมหานครกับจังหวัดสมุทรสาครเป็นเส้นแบ่งเขต