รายการแฟนพันธุ์แท้ถูกตั้งคำถามบ่อยครั้งถึงความถูกต้องของข้อมูล มีผู้โพสต์อินเทอร์เน็ตเว็บบอร์ด เช่น ในพันทิป.คอม ได้พิสูจน์ว่า รายการให้คำตอบผิดในหลายโอกาส ยิ่งไปกว่านั้น มีการกล่าวหาว่ารายการให้ข้อได้เปรียบแก่ผู้เข้าแข่งขันที่มีชื่อเสียง โดยเฉพาะอย่างยิ่ง ในธุรกิจการแสดง เหนือบุคคลทั่วไปที่เข้าแข่งขันในหัวข้อเดียวกัน อย่างไม่ยุติธรรม[6][7][8]