เรื่องราวกล่าวขานถึงโลกในนิยายที่ชื่อว่า "เอิร์ทแลนด์" ดินแดนที่ไม่ว่าใครก็สามารถใช้เวทมนตร์ได้ แต่การจะใช้เวทมนตร์ได้จะต้องสังกัดกิลด์ที่ถูกต้องตามกฎหมายเสียก่อน ลูซี่ ฮาร์ทฟิเลีย เด็กสาวผู้ใฝ่ฝันอยากจะเป็นหนึ่งในสมาชิกของ แฟรี่เทล กิลด์จอมเวทที่ยิ่งใหญ่ที่สุดในขณะนั้น จึงได้เดินทางออกจากคฤหาสน์ฮาร์ทฟิเลียอันเป็นบ้านเกิด เพื่อตามหาความฝันของเธอ และนั่นจึงทำให้เธอได้พบกับ นัตสึ ดรากูนีล จอมเวทผู้ใช้เวทสังหารมังกรที่เดินทางตามหา อิกนีล มังกรที่เลี้ยงเขามาตั้งแต่เด็ก และ แฮปปี้ ประชากรเผ่าเอ็กซ์ซีดที่อพยพหนีมาตั้งแต่ยังไม่เกิดและได้มาอยู่กับนัตสึและทุกคนในแฟรี่เทล นัตสึ รู้สึกถูกชะตากับลูซี่มากจึงได้ชักชวนเธอเข้ากิลด์แฟรี่เทล ที่นั่นทำให้เธอได้พบกับสมาชิกหลักคนอื่น ๆ ของแฟรี่เทล อาทิ เกรย์ ฟูลบัสเตอร์ จอมเวทน้ำแข็ง เอลซ่า สการ์เล็ต จอมเวทที่แข็งแกร่งที่สุดของแฟรี่เทล และเวนดี้ มาร์เวล อีกหนึ่งจอมเวทสังหารมังกร และนั่นจึงทำให้เธอได้พบกับอีกด้านของการผจญภัยที่เธอไม่เคยได้สัมผัสมาก่อน

หลายการผจญภัยผ่านไป ในที่สุดเธอได้เข้าร่วมกิจกรรมใหญ่ของแฟรี่เทลอย่างการคัดเลือกจอมเวทระดับ S คนใหม่ นอกจากความท้าทายที่เธอไม่เคยเจอในการผจญภัยอื่น ๆ มาก่อน เหตุการณ์นั้นยังทำให้เธอได้พบกับความน่าสยดสยองของกิลด์แห่งความมืดอันดับหนึ่งของสมาพันธ์บาลามอย่าง กริมัวร์ฮาร์ท ที่นำโดยอดีตหัวหน้ากิลด์แฟรี่เทลคนก่อน ฟิลฮิโตะ เกโบลก์(เพรช) รวมถึงจอมเวทดำผู้ที่เป็นอมตะและคอยแสวงหาความตายอยู่ตลอด เซเรฟ ดรากูนีล และ แอคโนโลเกีย มังกรตัวสุดท้ายในโลกที่ตั้งต้นเป็นศัตรูของมนุษยชาต เหตุการณ์ครั้งนั้นแม้แฟรี่เทลจะเป็นฝ่ายชนะกริมัวร์ฮาร์ท แต่ก็มิอาจหลีกเลี่ยงโชคชะตาของแอคโนโลเกียได้ ท้ายที่สุดสมาชิกหลักของแฟรี่เทลทุกคนถูกผนึกเอาไว้ในเกาะศักดิ์สิทธิ์เทนโรวจิม่าเป็นระยะเวลา 7 ปี

7 ปีต่อมา แฟรี่เทลกลายเป็นกิลด์ที่มีอันดับแย่ที่สุด ทำผลงานได้แย่ที่สุด สมาชิกหลักที่ถูกปลดผนึกจึงได้รับหน้าที่ให้ไปกอบกู้ชื่อเสียงของกิลด์กลับคืนมาด้วยการแข่งขันประลองเวทมนตร์ประจำปี แฟรี่เทลสามารถเอาชนะทุกกิลด์ได้อย่างยากเย็น ชัยชนะครั้งนั้นหารู้ไม่ว่าไม่เพียงแค่กี่นาทีนับจากนั้นก็เป็นหายนะของมนุษยชาต เมื่อ ฮิซุย องค์หญิงของประเทศฟิโอเร่ได้ใช้พลังเวทอัญเชิญเทพแห่งดวงดาว ปลดล็อกประตูมิติ อีคลิปส์(Eclipse) ที่เชื่อมกับอดีต ทำให้มังกรจากอดีตบุกเข้ามาโจมตีและเกิดเป็นสงครามแบบฉับพลัน สงครามในครั้งนั้นนอกจากทำให้ได้รู้ว่า แอคโนโลเกีย ไม่ใช่มังกรแต่กำเนิด แต่เป็นจอมเวทสังหารมังกรที่กลายร่างเป็นมังกรเต็มขั้นแล้วนั้น ยังเป็นการนำทางไปสู่สงครามใหญ่ที่ไม่ว่าใครก็มิอาจจินตนาการได้ถึง นั่นคือการบุกรุกฟิโอเร่ของกิลด์แห่งความมืด ทาร์ทารอส โดยมีเป้าหมายคือทำลายระบบเวทมนตร์ให้สิ้นซากด้วยอาวุธที่ร้ายแรงที่สุดของสภาเวทมนตร์อย่าง เฟซ และดึงตัวนัตสึกลับคืนสู่การเป็นปีศาจที่แข็งแกร่งที่สุด E.N.D อีเธอร์เรียส นัตสึ ดรากูนีล อันเป็นมาสเตอร์ที่แท้จริงของทาร์ทารอส นัตสึ เกรย์ และลูซี่ สามารถเอาชนะสงครามนี้ได้อย่างยากเย็น แต่นั่นก็มีเหตุผลมากพอที่จะทำให้ มาร์คารอฟ เดรเยอร์ มาสเตอร์เพียงหนึ่งเดียวของแฟรี่เทลประกาศยุบกิลด์แฟรี่เทล เพราะเมื่อฟิโอเร่ไร้ซึ่งระบบการป้องกันอย่าง เฟซ และเอเทเรี่ยน จึงเป็นโอกาสของกองทัพฝั่งตะวันตกอย่าง อัลบาเรซ อันนำทัพโดยราชาสปริกกันหรือเซเรฟ จะบุกโจมตีจนเกิดเป็นสงครามใหญ่ในอนาคต

หนึ่งปีผ่านไป นัตสึรวมกำลังคนก่อตั้งแฟรี่เทลขึ้นมาใหม่อีกครั้งโดยมีเอลซ่าเป็นหัวหน้ากิลด์ เอลซ่าตัดสินใจเข้าไปชิงตัวมาร์คารอฟออกมาจากอาราคิตาเซีย แต่ภารกิจนั้นกลับเป็นจุดชนวนสงครามระหว่างอัลบาเรซกับแฟรี่เทล เพราะเพียงแค่ต้องการ แฟรี่ฮาร์ท พลังเวทมนตร์อันไร้ขีดจำกัดของ เมวิส เวอร์มิลเลียน จอมเวทผู้ก่อตั้งแฟรี่เทล สมาชิกทุกคนจึงไม่มีทางเลือกนอกจากต้องต่อสู้กับกองกำลังที่แข็งแกร่งที่สุดเพื่อปกป้องผู้ก่อตั้งเอาไว้ให้ได้ แต่สุดท้ายเซเรฟก็ได้แฟรี่ฮาร์ทไปครอง นัตสึจึงไม่มีทางเลือกนอกจากฆ่าเซเรฟแม้นั่นจะทำให้ตัวเองต้องตายไปด้วยก็ตาม ด้านลูซี่ที่ได้ E.N.D มาอยู่ในมือ จึงตัดสินใจแก้ข้อความบางอย่างใน E.N.D เพื่อเปลี่ยนให้นัตสึกลับกลายจากปีศาจเป็นมนุษย์ธรรมดา นั่นจึงเป็นโอกาสเดียวที่ทำให้นัตสึเผด็จศึกสงครามนี้ได้สำเร็จ ท้ายที่สุดเซเรฟก็ตายตามความปรารถนา และเมวิสก็ตายตามไปด้วยเช่นกัน แต่ไม่กี่นาทีจากนั้นแอคโนโลเกียก็ปรากฏขึ้น พร้อมกับประกาศว่าจะล้างบางมังกรทั้งหมดในโลก จอมเวทสังหารมังกรทั้ง 7 จึงถูกดูดเข้าไปในร่างกายของแอคโนโลเกีย สมาชิกทั้งหมดจึงไม่มีทางเลือกนอกจากเอาชนะแอคโนโลเกียให้ได้เพื่อที่จะได้กลับไปยังอนาคตใหม่ที่วางไว้และพวกเขาก็ทำได้สำเร็จ

หลายปีผ่านไป แฟรี่เทลกลับคืนสู่ความสงบสุขดังเดิมอีกครั้ง พวกเขาจึงตัดสินใจออกเดินทางครั้งใหม่ สู่ภารกิจที่ไม่เคยมีจอมเวทคนใดทำสำเร็จแม้แต่คนเดียว นั่นคือการ ผนึกมังกรทั้ง 5 ที่ยังรับใช้ต่อแอคโนโลเกีย