แม่น้ำมารีกีนา (ตากาล็อก: Ilog Marikina) เป็นแม่น้ำสายหนึ่งในเมโทรมะนิลา ประเทศฟิลิปปินส์ โดยเป็นลำน้ำสาขาของแม่น้ำปาซิก ต้นน้ำตั้งอยู่ที่ภูเขาซีเอร์รา มาเดรในจังหวัดรีซัลแม่น้ำมารีกีนาเป็นเส้นทางขนส่งที่สำคัญในยุคอาณานิคมของสเปน แต่ได้ถูกลดทอนความสำคัญลงอันเนื่องจากการก่อสร้างทางหลวงแผ่นดิน การขาดเรือขนส่งและการทำลายป่าริมแม่น้ำทำให้มีการจัดตั้งเขตปกป้องลุ่มน้ำมารีกีนาตอนบน[1]ปัจจุบันแม่น้ำมารีกีนามีปัญหามลพิษทางน้ำ เนื่องจากความไม่ใส่ใจด้านสิ่งแวดล้อมของประชาชน และการพัฒนาอุตสาหกรรม